Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01369
• Subject: XM_011244034.2
• Aligned Length: 1282
• Identities: 932
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGA  41
                                             |||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct    1  ATGCTTGTAAGATTCTTTGGGAGCCCTGGAAACATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGA  74

Query   42  GCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCTTACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTA  115
            |||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  GCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGTTAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTA  148

Query  116  TGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCCATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAG  189
            ||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||
Sbjct  149  TGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCCACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAG  222

Query  190  ATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGGTCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTC  263
            ||||||||||||||||.|.||||..|||.|||||||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|.
Sbjct  223  ATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGGTCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTG  296

Query  264  TGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGCTTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTG  337
            .||.|||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCCTTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCG  370

Query  338  GAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTTTGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCT  411
            ||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCTTAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCT  444

Query  412  GTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGTGCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CA  484
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| ||
Sbjct  445  GTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACTGCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA  518

Query  485  GATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGACAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGAT  558
             |||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.
Sbjct  519  -ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGACCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAG  591

Query  559  GAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAGAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTC  632
            |...|||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  592  GGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAAGAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTC  665

Query  633  TGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-G  705
            ..||||||||||||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| |
Sbjct  666  CATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCCGAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGG  739

Query  706  GCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTAC  779
            |||| ||..||.||||...|||||||..||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  740  GCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCAGGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTAC  812

Query  780  AACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTG---  850
            .||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  813  GACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG  886

Query  851  ------------------------------------------------------------------AAGGCACT  858
                                                                              ||||||||
Sbjct  887  ATGCCAGAAGGAAGGCAGCTGGGCCAGCAGAGAGGCCTGAACTCAGGCCTCAACAATGGCTGCAGCAAGGCACT  960

Query  859  TCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCA  932
            |||||||||||||||.||.||||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  961  TCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCACTAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATTCTCCA  1034

Query  933  GTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACA  1006
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1035  GTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATTCTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGTCTACA  1108

Query 1007  CCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGAGACAACA-----TTTTGC-TCT------GTCACCCAA---GCT  1065
            |||||||||.|||||||||||||||||||||..||.||     |..||| |||      ||    |||   |||
Sbjct 1109  CCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGATTCATCAGGTCTTCATGCATCTGGGCTGGT----CAAGGTGCT  1178

Query 1066  GAACTGA-----------ACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATG  1128
            ||.||.|           ||||||            ||||                                  
Sbjct 1179  GAGCTCATCTTCTGTATTACTGGG------------TCCC----------------------------------  1206

Query 1129  TGCCACCATACCCAGCTAATTTTT  1152
                                    
Sbjct 1207  ------------------------  1206