Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01369
- Subject:
- XM_011244035.2
- Aligned Length:
- 1258
- Identities:
- 932
- Gaps:
- 182
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGA 41
|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1 ATGCTTGTAAGATTCTTTGGGAGCCCTGGAAACATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGA 74
Query 42 GCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCTTACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTA 115
|||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 75 GCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGTTAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTA 148
Query 116 TGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCCATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAG 189
||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||
Sbjct 149 TGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCCACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAG 222
Query 190 ATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGGTCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTC 263
||||||||||||||||.|.||||..|||.|||||||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|.
Sbjct 223 ATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGGTCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTG 296
Query 264 TGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGCTTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTG 337
.||.|||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCCTTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCG 370
Query 338 GAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTTTGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCT 411
||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 GAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCTTAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCT 444
Query 412 GTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGTGCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CA 484
|||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| ||
Sbjct 445 GTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACTGCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA 518
Query 485 GATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGACAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGAT 558
|||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.
Sbjct 519 -ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGACCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAG 591
Query 559 GAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAGAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTC 632
|...|||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 592 GGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAAGAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTC 665
Query 633 TGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-G 705
..||||||||||||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| |
Sbjct 666 CATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCCGAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGG 739
Query 706 GCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGAGGAGTTTTCAATCCCA----------------------- 756
|||| ||..||.||||...|||||||..||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 740 GCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCAGGGGAGTTTTCAATCCCAGGAGAGAGGAAGATGCCTGCCAC 812
Query 757 ----------------------GTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTC 808
|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 813 ATCTGCATCTTCAGGAGGGAAGGTTATCTTGACGAATCAAATTACGACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTC 886
Query 809 AGGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCC 882
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.
Sbjct 887 AAGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCT 960
Query 883 GCACTAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACA 956
|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 961 GCACTAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATTCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCA 1034
Query 957 GATTCTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTC 1030
||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1035 GATTCTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGTCTACACCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTC 1108
Query 1031 TTCAAGAGACAACA-----TTTTGC-TCT------GTCACCCAA---GCTGAACTGA-----------ACTGGG 1078
|||||||..||.|| |..||| ||| || ||| |||||.||.| ||||||
Sbjct 1109 TTCAAGATTCATCAGGTCTTCATGCATCTGGGCTGGT----CAAGGTGCTGAGCTCATCTTCTGTATTACTGGG 1178
Query 1079 CTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 1152
||||
Sbjct 1179 ------------TCCC---------------------------------------------------------- 1182