Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01376
- Subject:
- NM_001290276.1
- Aligned Length:
- 1344
- Identities:
- 1008
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 ATGTTTGACTGTATGGATGTTCTGTCAGTGAGTCCTGGGCAAATCCTGGATTTCTACACTGCGAGTCCGTCTTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCATGCTCCAGGAGAAAGCTCTCAAAGCATGCTTCAGTGGATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGCTCAATCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTG 34
Query 371 TTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 TTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAA 108
Query 445 GAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 GAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAAT 182
Query 519 GACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 GACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGC 256
Query 593 TGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGT 330
Query 667 GAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 GAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCAT 404
Query 741 CGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 CGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACCC 478
Query 815 CAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGGT 552
Query 889 CCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCT 626
Query 963 TCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 TCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAG 700
Query 1037 AACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 AACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATC 774
Query 1111 TTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 TTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAAT 848
Query 1185 TCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 TCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTT 922
Query 1259 CAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 CAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCA 996
Query 1333 CCACTCGTGCAA 1344
||||||||||||
Sbjct 997 CCACTCGTGCAA 1008