Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01405
- Subject:
- NR_033909.1
- Aligned Length:
- 613
- Identities:
- 442
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGGT 5
|||||
Sbjct 1 TGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAATTCTCATAGGAGCCACAGCGCGGAGACTGTGAAACATGGT 74
Query 6 TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGAGGGCTCACTCCATG 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGAGGGCTCACTCCATG 148
Query 80 TCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCTCAATGGTTTGAAACCCAGCACATCAATATGACCTCCCAG---CAATGC 150
||||||||||||||||||||||||||||..||||||| .|..|||||.||.|| .|||| ||||||
Sbjct 149 TCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCTCAGGGGTTTGA-----CGTCCATCAGTAGGA---ACCAGCTCCAATGC 214
Query 151 ACCAATGCAATGCAGGTCATTAACAATTATCAACGGCGATGCAAAAACCAAAATACTTTCCTTCTTACAACTTT 224
|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 215 ACCAATGCAATGCGGGTAATTAACAATTATCAACGGCGATGGAAAAACCAAAATACTTTTCTTCTTGCAACTTT 288
Query 225 TGCTAACGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAAATATGACCTGTCCTAGTAACAAAACTCGCAAAAATTGTCACC 298
||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|||..|||||.|||||.|||.||||||||.|
Sbjct 289 TGCTAATGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAACTATAACCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATC 362
Query 299 ACAGTGGAAGCCAGGTGCCTTTAATCCACTGTAACCTCACAACTCCAAGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGG 372
|.||||||..|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 ATAGTGGAGTCCAGGTGCCTTTAATGTACTGTAACCTCACAACTCCAAGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGG 436
Query 373 TATGCGCAGACACCAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGAGATCAACGACGAGACCCTCCACA 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 437 TATGCGCAGACACCAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGGGATCAACGACGGGACCCTCCACA 510
Query 447 GTATCCGGTGGTTCCAGTTCACCTGGATAGAATCATC------------------------------------- 483
||||||.||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 511 GTATCCAGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCATCATCTAAGCTCCTGTATCAGCACTCCTCGTCATCACTCATC 584
Query 484 --------------------- 483
Sbjct 585 TGCCAAGCTCCTCAATCATAG 605