Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01486
• Subject: NM_001128164.1
• Aligned Length: 2445
• Identities: 2445
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAATCCAACCAAGAGCGGAGCAACGAATGCCTGCCTCCCAAGAAGCGCGAGATCCCCGCCACCAGCCGGTC  74
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Sbjct    1  ATGAAATCCAACCAAGAGCGGAGCAACGAATGCCTGCCTCCCAAGAAGCGCGAGATCCCCGCCACCAGCCGGTC  74

Query   75  CTCCGAGGAGAAGGCCCCTACCCTGCCCAGCGACAACCACCGGGTGGAGGGCACAGCATGGCTCCCGGGCAACC  148
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Sbjct   75  CTCCGAGGAGAAGGCCCCTACCCTGCCCAGCGACAACCACCGGGTGGAGGGCACAGCATGGCTCCCGGGCAACC  148

Query  149  CTGGTGGCCGGGGCCACGGGGGCGGGAGGCATGGGCCGGCAGGGACCTCGGTGGAGCTTGGTTTACAACAGGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGTGGCCGGGGCCACGGGGGCGGGAGGCATGGGCCGGCAGGGACCTCGGTGGAGCTTGGTTTACAACAGGGA  222

Query  223  ATAGGTTTACACAAAGCATTGTCCACAGGGCTGGACTACTCCCCGCCCAGCGCTCCCAGGTCTGTCCCCGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATAGGTTTACACAAAGCATTGTCCACAGGGCTGGACTACTCCCCGCCCAGCGCTCCCAGGTCTGTCCCCGTGGC  296

Query  297  CACCACGCTGCCTGCCGCGTACGCCACCCCGCAGCCAGGGACCCCGGTGTCCCCCGTGCAGTACGCTCACCTGC  370
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Sbjct  297  CACCACGCTGCCTGCCGCGTACGCCACCCCGCAGCCAGGGACCCCGGTGTCCCCCGTGCAGTACGCTCACCTGC  370

Query  371  CGCACACCTTCCAGTTCATTGGGTCCTCCCAATACAGTGGAACCTATGCCAGCTTCATCCCATCACAGCTGATC  444
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Sbjct  371  CGCACACCTTCCAGTTCATTGGGTCCTCCCAATACAGTGGAACCTATGCCAGCTTCATCCCATCACAGCTGATC  444

Query  445  CCCCCAACCGCCAACCCCGTCACCAGTGCAGTGGCCTCGGCCGCAGGGGCCACCACTCCATCCCAGCGCTCCCA  518
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Sbjct  445  CCCCCAACCGCCAACCCCGTCACCAGTGCAGTGGCCTCGGCCGCAGGGGCCACCACTCCATCCCAGCGCTCCCA  518

Query  519  GCTGGAGGCCTATTCCACTCTGCTGGCCAACATGGGCAGTCTGAGCCAGACGCCGGGACACAAGGCTGAGCAGC  592
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Sbjct  519  GCTGGAGGCCTATTCCACTCTGCTGGCCAACATGGGCAGTCTGAGCCAGACGCCGGGACACAAGGCTGAGCAGC  592

Query  593  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG  666
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Sbjct  593  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG  666

Query  667  CAGCAGCAGCACCTCAGCAGGGCTCCGGGGCTCATCACCCCGGGGTCCCCCCCACCAGCCCAGCAGAACCAGTA  740
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Sbjct  667  CAGCAGCAGCACCTCAGCAGGGCTCCGGGGCTCATCACCCCGGGGTCCCCCCCACCAGCCCAGCAGAACCAGTA  740

Query  741  CGTCCACATTTCCAGTTCTCCGCAGAACACCGGCCGCACCGCCTCTCCTCCGGCCATCCCCGTCCACCTCCACC  814
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Sbjct  741  CGTCCACATTTCCAGTTCTCCGCAGAACACCGGCCGCACCGCCTCTCCTCCGGCCATCCCCGTCCACCTCCACC  814

Query  815  CCCACCAGACGATGATCCCACACACGCTCACCCTGGGGCCCCCCTCCCAGGTCGTCATGCAATACGCCGACTCC  888
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Sbjct  815  CCCACCAGACGATGATCCCACACACGCTCACCCTGGGGCCCCCCTCCCAGGTCGTCATGCAATACGCCGACTCC  888

Query  889  GGCAGCCACTTTGTCCCTCGGGAGGCCACCAAGAAAGCTGAGAGCAGCCGGCTGCAGCAGGCCATCCAGGCCAA  962
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Sbjct  889  GGCAGCCACTTTGTCCCTCGGGAGGCCACCAAGAAAGCTGAGAGCAGCCGGCTGCAGCAGGCCATCCAGGCCAA  962

Query  963  GGAGGTCCTGAACGGTGAGATGGAGAAGAGCCGGCGGTACGGGGCCCCGTCCTCAGCCGACCTGGGCCTGGGCA  1036
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Sbjct  963  GGAGGTCCTGAACGGTGAGATGGAGAAGAGCCGGCGGTACGGGGCCCCGTCCTCAGCCGACCTGGGCCTGGGCA  1036

Query 1037  AGGCAGGCGGCAAGTCGGTTCCTCACCCGTACGAGTCCAGGCACGTGGTGGTCCACCCGAGCCCCTCAGACTAC  1110
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Sbjct 1037  AGGCAGGCGGCAAGTCGGTTCCTCACCCGTACGAGTCCAGGCACGTGGTGGTCCACCCGAGCCCCTCAGACTAC  1110

Query 1111  AGCAGTCGTGATCCTTCGGGGGTCCGGGCCTCTGTGATGGTCCTGCCCAACAGCAACACGCCCGCAGCTGACCT  1184
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Sbjct 1111  AGCAGTCGTGATCCTTCGGGGGTCCGGGCCTCTGTGATGGTCCTGCCCAACAGCAACACGCCCGCAGCTGACCT  1184

Query 1185  GGAGGTGCAACAGGCCACTCATCGTGAAGCCTCCCCTTCTACCCTCAACGACAAAAGTGGCCTGCATTTAGGGA  1258
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Sbjct 1185  GGAGGTGCAACAGGCCACTCATCGTGAAGCCTCCCCTTCTACCCTCAACGACAAAAGTGGCCTGCATTTAGGGA  1258

Query 1259  AGCCTGGCCACCGGTCCTACGCGCTCTCACCCCACACGGTCATTCAGACCACACACAGTGCTTCAGAGCCACTC  1332
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Sbjct 1259  AGCCTGGCCACCGGTCCTACGCGCTCTCACCCCACACGGTCATTCAGACCACACACAGTGCTTCAGAGCCACTC  1332

Query 1333  CCGGTGGGACTGCCAGCCACGGCCTTCTACGCAGGGACTCAACCCCCTGTCATCGGCTACCTGAGCGGCCAGCA  1406
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Sbjct 1333  CCGGTGGGACTGCCAGCCACGGCCTTCTACGCAGGGACTCAACCCCCTGTCATCGGCTACCTGAGCGGCCAGCA  1406

Query 1407  GCAAGCAATCACCTACGCCGGCAGCCTGCCCCAGCACCTGGTGATCCCCGGCACACAGCCCCTGCTCATCCCGG  1480
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Sbjct 1407  GCAAGCAATCACCTACGCCGGCAGCCTGCCCCAGCACCTGGTGATCCCCGGCACACAGCCCCTGCTCATCCCGG  1480

Query 1481  TCGGCAGCACTGACATGGAAGCGTCGGGGGCAGCCCCGGCCATAGTCACGTCATCCCCCCAGTTTGCTGCAGTG  1554
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Sbjct 1481  TCGGCAGCACTGACATGGAAGCGTCGGGGGCAGCCCCGGCCATAGTCACGTCATCCCCCCAGTTTGCTGCAGTG  1554

Query 1555  CCTCACACGTTCGTCACCACCGCCCTTCCCAAGAGCGAGAACTTCAACCCTGAGGCCCTGGTCACCCAGGCCGC  1628
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Sbjct 1555  CCTCACACGTTCGTCACCACCGCCCTTCCCAAGAGCGAGAACTTCAACCCTGAGGCCCTGGTCACCCAGGCCGC  1628

Query 1629  CTACCCAGCCATGGTGCAGGCCCAGATCCACCTGCCTGTGGTGCAGTCCGTGGCCTCCCCGGCGGCGGCTCCCC  1702
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Sbjct 1629  CTACCCAGCCATGGTGCAGGCCCAGATCCACCTGCCTGTGGTGCAGTCCGTGGCCTCCCCGGCGGCGGCTCCCC  1702

Query 1703  CTACGCTGCCTCCCTACTTCATGAAAGGCTCCATCATCCAGTTGGCCAACGGGGAGCTAAAGAAGGTGGAAGAC  1776
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Sbjct 1703  CTACGCTGCCTCCCTACTTCATGAAAGGCTCCATCATCCAGTTGGCCAACGGGGAGCTAAAGAAGGTGGAAGAC  1776

Query 1777  TTAAAAACAGAAGATTTCATCCAGAGTGCAGAGATAAGCAACGACCTGAAGATCGACTCCAGCACCGTAGAGAG  1850
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Sbjct 1777  TTAAAAACAGAAGATTTCATCCAGAGTGCAGAGATAAGCAACGACCTGAAGATCGACTCCAGCACCGTAGAGAG  1850

Query 1851  GATTGAAGACAGCCATAGCCCGGGCGTGGCCGTGATACAGTTCGCCGTCGGGGAGCACCGAGCCCAGGTCAGCG  1924
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Sbjct 1851  GATTGAAGACAGCCATAGCCCGGGCGTGGCCGTGATACAGTTCGCCGTCGGGGAGCACCGAGCCCAGGTCAGCG  1924

Query 1925  TTGAAGTTTTGGTAGAGTATCCTTTTTTTGTGTTTGGACAGGGCTGGTCATCCTGCTGTCCGGAGAGAACCAGC  1998
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Sbjct 1925  TTGAAGTTTTGGTAGAGTATCCTTTTTTTGTGTTTGGACAGGGCTGGTCATCCTGCTGTCCGGAGAGAACCAGC  1998

Query 1999  CAGCTCTTTGATTTGCCGTGTTCCAAACTCTCAGTTGGGGATGTCTGCATCTCGCTTACCCTCAAGAACCTGAA  2072
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Sbjct 1999  CAGCTCTTTGATTTGCCGTGTTCCAAACTCTCAGTTGGGGATGTCTGCATCTCGCTTACCCTCAAGAACCTGAA  2072

Query 2073  GAACGGCTCTGTTAAAAAGGGCCAGCCCGTGGATCCCGCCAGCGTCCTGCTGAAGCACTCAAAGGCCGACGGCC  2146
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Sbjct 2073  GAACGGCTCTGTTAAAAAGGGCCAGCCCGTGGATCCCGCCAGCGTCCTGCTGAAGCACTCAAAGGCCGACGGCC  2146

Query 2147  TGGCGGGCAGCAGACACAGGTATGCCGAGCAGGAAAACGGAATCAACCAGGGGAGTGCCCAGATGCTCTCTGAG  2220
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Sbjct 2147  TGGCGGGCAGCAGACACAGGTATGCCGAGCAGGAAAACGGAATCAACCAGGGGAGTGCCCAGATGCTCTCTGAG  2220

Query 2221  AATGGCGAACTGAAGTTTCCAGAGAAAATGGGATTGCCTGCAGCGCCCTTCCTCACCAAAATAGAACCCAGCAA  2294
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Sbjct 2221  AATGGCGAACTGAAGTTTCCAGAGAAAATGGGATTGCCTGCAGCGCCCTTCCTCACCAAAATAGAACCCAGCAA  2294

Query 2295  GCCCGCGGCAACGAGGAAGAGGAGGTGGTCGGCGCCAGAGAGCCGCAAACTGGAGAAGTCAGAAGACGAACCAC  2368
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Sbjct 2295  GCCCGCGGCAACGAGGAAGAGGAGGTGGTCGGCGCCAGAGAGCCGCAAACTGGAGAAGTCAGAAGACGAACCAC  2368

Query 2369  CTTTGACTCTTCCTAAGCCTTCTCTAATTCCTCAGGAGGTTAAGATTTGCATTGAAGGCCGGTCTAATGTAGGC  2442
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Sbjct 2369  CTTTGACTCTTCCTAAGCCTTCTCTAATTCCTCAGGAGGTTAAGATTTGCATTGAAGGCCGGTCTAATGTAGGC  2442

Query 2443  AAG  2445
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Sbjct 2443  AAG  2445