Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01526
• Subject: XM_011248836.2
• Aligned Length: 1168
• Identities: 983
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCTG----AGACACTCTTCTGGACTCCTCTCCTCGTGGTTCTCCTGGCAGGGCTGGGGGACACCGAGGCCC  70
            |||||.|    ||..|||    ||||..||||||||.|..|.||||||||||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCAGCAGTAACT----TGGATACCTCTCCTGGCAGGTCTCCTGGCAGGACTGAGGGACACCAAGGCCC  70

Query   71  AGCAGACCACGCTACACCCACTTGTGGGCCGTGTCTTTGTGCACACCTTGGACCATGAGACGTTTCTGAGCCTT  144
            |||||||.||..||||||.|||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.||||..||.||.|||.|||||
Sbjct   71  AGCAGACAACTTTACACCTACTTGTGGGTCGTGTGTTTGTGCATCCTTTGGAACATGCCACCTTCCTGCGCCTT  144

Query  145  CCTGAGCATGTCGCTGTCCCACCCGCTGTCC-ACATCACCTACCACGCCCACCTCCAGGGACACCCAGACCTGC  217
            ||.||.||.||.||.||.||||||.|||||| || |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  145  CCAGAACACGTTGCGGTGCCACCCACTGTCCGAC-TCACCTACCACGCTCACCTCCAGGGACATCCAGACCTGC  217

Query  218  CCCGGTGGCTCCGCTACACCCAGCGCAGCCCCCACCACCCTGGCTTCCTCTACGGCTCTGCCACCCCAGAAGAT  291
            ||.|||||||.|.||||||.||||||||.|||.|..||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
Sbjct  218  CCAGGTGGCTGCACTACACACAGCGCAGTCCCTATAACCCTGGCTTCCTCTACGGCTCCCCCACTCCAGAAGAT  291

Query  292  CGTGGGCTCCAGGTCATTGAGGTCACAGCCTACAATCGGGACAGCTTTGATACCACTCGGCAGAGGCTGGTGCT  365
            ||||||..|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|.|||||||||.||||
Sbjct  292  CGTGGGTACCAAGTCATCGAGGTCACAGCCTACAATCGAGACAGTTTTGACACCACTAGACAGAGGCTGCTGCT  365

Query  366  GGAGATTGGGGACCCAGAAGGCCCCCTGCTGCCATACCAAGCCGAGTTCCTGGTGCGCAGCCACGATGCGGAGG  439
            |..||||||||||||.|||||.||||.|.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  366  GCTGATTGGGGACCCCGAAGGTCCCCGGTTGCCATACCAAGCTGAGTTCCTGGTGCGCAGCCATGATGTGGAGG  439

Query  440  AGGTGCTGCCCTCAACACCTGCCAGCCGCTTCCTCTCAGCCTTGGGGGGACTCTGGGAGCCCGGAGAGCTTCAG  513
            |||||||||||.|.||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  440  AGGTGCTGCCCACCACACCTGCCAACCGCTTCCTCACCGCCTTGGGGGGACTGTGGGAGCCAGGAGAGCTTCAG  513

Query  514  CTGCTCAACGTCACCTCTGCCTTGGACCGTGGGGGCCGTGTCCCCCTTCCCATTGAGGGCCGAAAAGAAGGGGT  587
            |||||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  514  CTGCTCAACATCACTTCCGCCTTGGACCGGGGAGGCCGAGTCCCTCTTCCTATTGAGGGACGGAAGGAAGGGGT  587

Query  588  ATACATTAAGGTGGGTTCTGCCTCACCTTTTTCTACTTGCCTGAAGATGGTGGCATCCCCCGATAGCCACGCCC  661
            ||||||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct  588  ATACATTAAGGTAGGCTCTGCCACACCCTTCTCCACCTGCCTGAAGATGGTGGCGTCGCCCGACAGCTATGCCC  661

Query  662  GCTGTGCCCAGGGCCAGCCTCCACTTCTGTCTTGCTACGACACCTTGGCACCCCACTTCCGCGTTGACTGGTGC  735
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GTTGTGCCCAGGGACAGCCTCCACTACTGTCCTGCTACGACACTTTGGCACCCCACTTCCGCGTTGACTGGTGC  735

Query  736  AATGTGACCCTGGTGGATAAGTCAGTGCCGGAG--CCTGCAGATGAGGTGCCCACCCCAGGTGATGGGATCCTG  807
            ||||||.|.|||||.||.||||||||.||.|||  ||||  ||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||
Sbjct  736  AATGTGTCTCTGGTAGACAAGTCAGTACCCGAGCCCCTG--GATGAGGTACCTACTCCAGGCGATGGGATCTTG  807

Query  808  GAGCATGACCCGTTCTTCTGCCCACCCACTGAGGCCCCAGACCGTGACTTCTTGGTGGATGCTCTGGTCACCCT  881
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||.||...|||||..||||.|||||
Sbjct  808  GAGCACGACCCGTTCTTCTGCCCACCCACTGAAGCCACAGACCGAGACTTCCTGACAGATGCCTTGGTGACCCT  881

Query  882  CCTGGTGCCCCTGCTGGTGGCCCTGCTTCTCACCTTGCTGCTGGCCTATGTCATGTGCTGCCGGCGGGAGGGAA  955
            |.|||||||..||.|||||||.|||||.||.||..||.|||||||.||..|||||||||..|||||.||.|||.
Sbjct  882  CTTGGTGCCTTTGTTGGTGGCTCTGCTGCTTACTCTGTTGCTGGCTTACATCATGTGCTTTCGGCGTGAAGGAC  955

Query  956  GGCTGAAGAGAGACCTGGCTACCTCCGACATCCAGATGGTCCACCACTGCACCATCCACGGGAACACAGAGGAG  1029
            ||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  956  GGCTGAAGAGAGACATGGCCACCTCTGACATCCAGATGTTTCACCACTGTTCCATCCATGGGAATACAGAAGAG  1029

Query 1030  CTGCGGCAGATGGCGGCCAGCCGCGAGGTGCCCCGGCCACTCTCCACCCTGCCCATGTTCAATGTGCACACAGG  1103
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.|..|||||
Sbjct 1030  CTTCGGCAGATGGCAGCCAGCCGAGAGGTGCCCCGGCCTCTTTCCACCTTGCCCATGTTTAATGTTCGTACAGG  1103

Query 1104  TGAGCGGCTGCCTCCCCGCGTGGACAGCGCCCAGGTGCCCCTCATTCTGGACCAGCAC  1161
            .||||||.|.||||||||.||.||||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1104  AGAGCGGTTACCTCCCCGAGTAGACAGCGCACAGATGCCTCTTATCCTGGACCAGCAC  1161