Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01527
- Subject:
- XM_011536071.1
- Aligned Length:
- 1585
- Identities:
- 1274
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTAAACAAAGACATGAATGGATTCCCAGTCAAGAAATGCTCAGCCTTCCAATTTTTTAAGAAGCGGGTACG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAGGTGGATCAAGAGCCCAATGGTCAGTGTGGACAAGCATCAGAGTCCCAGCCTGAAGTACACCGGCTCCTCCA 148
Query 1 ----------------------------------------------------ATGAC--GGTGAAAACTGAGGC 20
|||.| ||||||.|
Sbjct 149 TGGTGCACATCCCTCCAGGGGAGCCAGACTTCGAGTCTTCCTTGTGTCAAACATGCCTGGGTGAACA------- 215
Query 21 TGCT-----AAGGG-----CACCCTCA-----------CTT-----------ACTC---CAGGAT--------- 50
|||| |||.| |.|||||| |.| |||| |.||.|
Sbjct 216 TGCTTTCCAAAGAGGGGTTCTCCCTCAGGAGAACGAGTCATGTTCATGGGAAACTCAATCTGGGTGTGAAGTGA 289
Query 51 GAGGGGCATG-----GTGGCAA----------------------------TTC-----------TCATC--GCT 78
|||.|.|||| .||.||| ||| |.||| |||
Sbjct 290 GAGAGCCATGTAATCATGCCAACATCCTGACCAAGCCCGATCCAAGAACCTTCTGGACTAATGATGATCCAGCT 363
Query 79 TTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACA 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 TTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACA 437
Query 153 CCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTC 226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 CCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTC 511
Query 227 CACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 CACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTC 585
Query 301 TTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGC 374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 TTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGC 659
Query 375 AGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTC 448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTC 733
Query 449 TGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTT 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 TGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTT 807
Query 523 GTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGC 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGC 881
Query 597 TCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAA 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAA 955
Query 671 AACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATT 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATT 1029
Query 745 GAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCC 818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCC 1103
Query 819 TTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTT 1177
Query 893 ATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAAT 966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 ATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAAT 1251
Query 967 TCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCAT 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 TCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCAT 1325
Query 1041 GGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTT 1114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 GGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTT 1399
Query 1115 TTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAAC 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 TTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAAC 1473
Query 1189 TCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTT 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 TCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTT 1547
Query 1263 TTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1293
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1578