Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01534
• Subject: NM_001270460.2
• Aligned Length: 1125
• Identities: 1032
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74

Query   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG  148

Query  149  GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTA  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  149  GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACT-------------  209

Query  223  GCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTT  296
                                                                                      
Sbjct  210  --------------------------------------------------------------------------  209

Query  297  CCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  370
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  ------GTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  277

Query  371  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  351

Query  445  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  425

Query  519  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  499

Query  593  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  573

Query  667  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  647

Query  741  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  721

Query  815  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  795

Query  889  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  869

Query  963  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  943

Query 1037  AGTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCACTGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  AGTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCACTGAT  1017

Query 1111  CTAAGCAGTGGCATC  1125
            |||||||||||||||
Sbjct 1018  CTAAGCAGTGGCATC  1032