Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01534
• Subject: NM_001350619.2
• Aligned Length: 1366
• Identities: 1106
• Gaps: 260

Alignment

Query    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74

Query   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCA------------------------------  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAGTAAGTATAGTCACTCTAGCTCACCCCAGG  148

Query  119  ---------------ATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTGGACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGG  177
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGCCTGTTGCAGATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTGGACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGG  222

Query  178  TTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGG  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGG  296

Query  252  AGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGT  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGT  370

Query  326  TCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGAC  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGAC  444

Query  400  AATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCG  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCG  518

Query  474  CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACA  592

Query  548  TTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATC  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATC  666

Query  622  ACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAA  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAA  740

Query  696  GTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAAT  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAAT  814

Query  770  CTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCC  888

Query  844  TTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGC  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGC  962

Query  918  AGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACG  1036

Query  992  CACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAG---------------------------  1038
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 1037  CACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAGCCAAGACCCCATGTGGAAAATCTGAAC  1110

Query 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038
                                                                                      
Sbjct 1111  CCTTCTGAACTCCGCTTGCCACACTTCTGCTTTGACCACCAGCCTTCCACTGATCCCAGCCTGAAACCTGGAAA  1184

Query 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038
                                                                                      
Sbjct 1185  TCTTGGGCCAGTTCTTCAACAGCTTCTCTGCTGCTACATCTGGGTGATGGGAGGTTGTTGGAGGGAACCTCCCA  1258

Query 1039  ---------------------TCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAA  1091
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTGTGCAGATTCCTGTTTCTTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAA  1332

Query 1092  AGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC  1125
            |||||||||||||||                   
Sbjct 1333  AGCTCGCGTCATCAC-------------------  1347