Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01534
• Subject: NM_001350620.2
• Aligned Length: 1321
• Identities: 1106
• Gaps: 215

Alignment

Query    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74

Query   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG  148

Query  149  GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTA  222

Query  223  GCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTT  296

Query  297  CCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  370

Query  371  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  444

Query  445  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  518

Query  519  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  592

Query  593  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  666

Query  667  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  740

Query  741  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  814

Query  815  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  888

Query  889  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  962

Query  963  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  1036

Query 1037  AG------------------------------------------------------------------------  1038
            ||                                                                        
Sbjct 1037  AGCCAAGACCCCATGTGGAAAATCTGAACCCTTCTGAACTCCGCTTGCCACACTTCTGCTTTGACCACCAGCCT  1110

Query 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038
                                                                                      
Sbjct 1111  TCCACTGATCCCAGCCTGAAACCTGGAAATCTTGGGCCAGTTCTTCAACAGCTTCTCTGCTGCTACATCTGGGT  1184

Query 1039  --------------------------------------------------TCCTGGACGCACAATATCCAGCGA  1062
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATGGGAGGTTGTTGGAGGGAACCTCCCATCTGTGCAGATTCCTGTTTCTTCCTGGACGCACAATATCCAGCGA  1258

Query 1063  GAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1259  GAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCAC-------------------  1302