Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01534
- Subject:
- NM_174971.5
- Aligned Length:
- 1287
- Identities:
- 1077
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA 74
Query 75 TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCA------------------------------ 118
Query 149 GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACT------------- 209
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 ------------------AGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTCTCACCGAGGACT 174
Query 210 -------------------------------------------------------------------------- 209
Sbjct 175 CTCTGCACGGTGGTTTTTGGCCTTGACTGCATATTGGAATCACCTGGAGAGCCTAAAAAATTACTGATGCCTGC 248
Query 210 -------------------------------------------------------------------------- 209
Sbjct 249 ATCCCACCCTCTAGAGATTTTGAAGTCACTGAGCGAGGACACAGCCTTTGCATTAGGATTTTTAAAGCTGCCCA 322
Query 210 -GCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTG 282
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 GGCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTG 396
Query 283 ATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAG 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 ATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAG 470
Query 357 AATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCA 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 AATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCA 544
Query 431 AAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTT 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 AAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTT 618
Query 505 CTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAA 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 CTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAA 692
Query 579 AGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTG 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 AGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTG 766
Query 653 AGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATC 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 AGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATC 840
Query 727 GTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCC 914
Query 801 TGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATG 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATG 988
Query 875 GCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAG 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 GCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAG 1062
Query 949 GTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCAT 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 GTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCAT 1136
Query 1023 GGCAGCCATCAAAGAGTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTC 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 GGCAGCCATCAAAGAGTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTC 1210
Query 1097 GCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC 1125
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC 1239