Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01551
- Subject:
- NM_015747.2
- Aligned Length:
- 2058
- Identities:
- 1814
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ------------ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCC-------TTTGG 55
.||||||| ||||||.|||||...|||||||....|.|||||.|.||| |.|
Sbjct 1 ATGGAATCTACTGTGGCAAC---GATTACTAGTACCCTAGCTGCTGTTACTGCTTCCGCTCCACCGAAGTAT-- 69
Query 56 TGGACTACCTATGGATGCTCATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGAT 129
|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 --GACAATCTATGGATGCTCATCCTGGGCTTCATCATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGAT 141
Query 130 GTAGCAAATTCTTTTGGTACAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCAT 203
|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 142 GTAGCAAATTCGTTCGGTACAGCTGTAGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCTTAGCTAGCAT 215
Query 204 CTTTGAAACAGTGGGCTCTGTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGG 277
|||.|||||.||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 216 CTTCGAAACTGTGGGCTCCGCCTTGCTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAACGGCTTGATAGATGTGG 289
Query 278 AGATGTACAACTCGACTCAAGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAA 351
||.||||||||...|||||||..||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 290 AGCTGTACAACGAAACTCAAGATCTGCTCATGGCTGGCTCCGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAG 363
Query 352 CTCGTGGCTTCGTTTTTGAAGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCT 425
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 364 CTCGTGGCTTCGTTTTTGAAGCTTCCGATTTCTGGGACCCATTGTATTGTCGGTGCAACCATTGGTTTCTCCCT 437
Query 426 CGTGGCAAAGGGGCAGGAGGGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCAC 499
.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 438 TGTGGCAAATGGGCAGAAGGGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCGTGGTTCGTCTCTCCGC 511
Query 500 TGCTTTCTGGAATTATGTCTGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTT 573
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 512 TGCTTTCTGGTATTATGTCTGGAATTTTATTCTTCCTTGTTCGTGCGTTCATCCTCCGTAAGGCAGATCCGGTT 585
Query 574 CCTAATGGTTTGCGAGCTTTGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATAC 647
||||||||.||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 586 CCTAATGGCTTACGAGCTTTACCAATTTTTTATGCCTGCACAATCGGAATCAACCTCTTTTCCATTATGTATAC 659
Query 648 TGGAGCACCGTTGCTGGGCTTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTT 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGGAGCACCGTTGCTGGGCTTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTT 733
Query 722 TCTGTGCCCTTATCGTCTGGTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGT 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 734 TCTGTGCCCTTATCGTCTGGTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAGTAAAGTCTAGT 807
Query 796 CCTTCTGAAAGCCCCTTAATGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGG 869
||.||||||||.||||||||||||||.||||..|.|||.||||||||||||||||||||||||.||.||..|||
Sbjct 808 CCGTCTGAAAGTCCCTTAATGGAAAAGAAGAGCAACTTAAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGATGGCTCCTGG 881
Query 870 TGATATTGAAAACAAGCATCCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGA 943
.||..||||..|.|.|.|||||||.||||||||||.|..||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 882 AGACGTTGAGCATAGGAATCCTGTGTCTGAGGTAGTGTGTGCCACTGGGCCACTCCGGGCTGTGGTGGAGGAGA 955
Query 944 GAACAGTCTCATTCAAACTTGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAA 1017
|.||.||.||||||||||||||.||..|||||||.|||||.|||.|||||.||||||||| |||||.||||.
Sbjct 956 GGACGGTGTCATTCAAACTTGGTGACCTGGAGGAGGCTCCGGAGCGAGAGCGGCTTCCCA---TGGACCTGAAG 1026
Query 1018 GAGGAAACCAGCATAGATAGCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCA 1091
|||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1027 GAGGAGACCAGCATAGACAGCACCATCAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTTCAGTTCAGTCA 1100
Query 1092 AGCCGTCAGCAACCAAATAAACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACA 1165
|.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1101 AACTGTCAGCAACCAGATCAACTCCAGTGGCCACTATCAGTATCACACCGTGCACAAGGATTCTGGCTTGTACA 1174
Query 1166 AAGAGCTACTCCATAAATTACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGG 1239
|.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1175 AGGAGCTGCTCCATAAGTTACATCTGGCCAAGGTGGGAGACTGCATGGGAGATTCTGGGGACAAGCCCTTGAGA 1248
Query 1240 CGCAATAATAGCTATACTTCCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGG 1313
|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 CGCAACAACAGCTACACTTCCTACACTATGGCAATATGTGGCATGCCCCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGG 1322
Query 1314 TGAACAGAAGGGCGAAGAAATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACA 1387
||||||.|||||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1323 TGAACAAAAGGGAGATGAAATGGAGACGCTGACATGGCCTAATGCAGATACCAAGAAGCGGATTCGAATGGACA 1396
Query 1388 GTTACACCAGTTACTGCAATGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAG 1461
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1397 GTTACACCAGTTACTGCAATGCCGTGTCTGACCTTCACTCCGAGTCTGAGATGGACATGAGTGTGAAGGCTGAG 1470
Query 1462 ATGGGTCTAGGTGACAGAAAAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTC 1535
|||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1471 ATGGGCCTGGGTGACAGAAAAGGAAGCAGTGGCTCTCTTGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTGTC 1544
Query 1536 TCTCCTCTTCCAGTTCCTGCAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCA 1609
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1545 CCTTCTCTTCCAGTTCCTGCAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTTGCCCATGGTGGCAATGACGTCAGCA 1618
Query 1610 ATGCCATTGGGCCTCTGGTTGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCA 1683
|||||||.||.||||||||||||||.|||.|.|||||| |.||| |||.|..|||.||||||.|||||||||.
Sbjct 1619 ATGCCATCGGCCCTCTGGTTGCTTTGTATCTTGTTTAT-AAACA--AGAAGCCTCTACAAAAGCGGCAACACCC 1689
Query 1684 ATATGGCTTCTACTCTATGGTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGAC 1757
|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 ATATGGCTTCTGCTTTATGGTGGTGTTGGCATTTGCATGGGCCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGAC 1763
Query 1758 CATGGGGAAGGATCTGACACCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGG 1831
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 1764 CATGGGGAAGGACCTGACCCCAATCACACCCTCCAGTGGTTTCAGTATTGAACTGGCGTCTGCCTTAACTGTGG 1837
Query 1832 TGATTGCATCAAATATTGGCCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGG 1905
|.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 TCATCGCATCAAACATTGGCCTTCCCATCAGCACAACACATTGCAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGG 1911
Query 1906 CTCCGGTCCAAGAAGGCTGTTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCAT 1979
|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1912 CTCCGATCAAAGAAGGCTGTTGACTGGCGACTGTTTCGAAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACGGTCCCCAT 1985
Query 1980 TTCTGGAGTTATCAGTGCTGCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCT--CAGAATG 2037
.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||..||..||||||| ||| ||
Sbjct 1986 CTCTGGGGTTATCAGTGCCGCTATCATGGCAGTATTCAAGTACATCATCCTGCCAG--TG 2043