Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01551
- Subject:
- XM_017004771.2
- Aligned Length:
- 2037
- Identities:
- 1278
- Gaps:
- 759
Alignment
Query 1 ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCCTTTGGTGGACTACCTATGGATGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGATGTAGCAAATTCTTTTGGTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCATCTTTGAAACAGTGGGCTCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGGAGATGTACAACTCGACTCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAACTCGTGGCTTCGTTTTTGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCTCGTGGCAAAGGGGCAGGAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCACTGCTTTCTGGAATTATGTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTTCCTAATGGTTTGCGAGCTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA 55
Query 815 TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT 129
Query 889 CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT 203
Query 963 TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA 277
Query 1037 GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA 351
Query 1111 AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT 425
Query 1185 ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT 499
Query 1259 CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA 573
Query 1333 ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA 647
Query 1407 TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA 721
Query 1481 AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG 795
Query 1555 CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT 869
Query 1629 TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG 943
Query 1703 GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA 1017
Query 1777 CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG 1091
Query 1851 CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG 1165
Query 1925 TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT 1239
Query 1999 GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG 2037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG 1278
