Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01551
- Subject:
- XM_024453052.1
- Aligned Length:
- 2037
- Identities:
- 1398
- Gaps:
- 639
Alignment
Query 1 ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCCTTTGGTGGACTACCTATGGATGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGATGTAGCAAATTCTTTTGGTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCATCTTTGAAACAGTGGGCTCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGGAGATGTACAACTCGACTCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAACTCGTGGCTTCGTTTTTGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCTCGTGGCAAAGGGGCAGGAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCACTGCTTTCTGGAATTATGTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTTCCTAATGGTTTGCGAGCTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC 666
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC 27
Query 667 TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG 101
Query 741 GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA 175
Query 815 TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT 249
Query 889 CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT 323
Query 963 TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA 397
Query 1037 GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA 471
Query 1111 AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT 545
Query 1185 ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT 619
Query 1259 CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA 693
Query 1333 ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA 767
Query 1407 TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA 841
Query 1481 AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG 915
Query 1555 CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT 989
Query 1629 TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG 1063
Query 1703 GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA 1137
Query 1777 CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG 1211
Query 1851 CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG 1285
Query 1925 TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT 1359
Query 1999 GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG 2037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG 1398