Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01568
- Subject:
- NM_001349460.1
- Aligned Length:
- 720
- Identities:
- 566
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGATGAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCG 74
|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGACTGTTGGCAAGAGTAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTATAGAATGAGATGTATCCTGCAAGATGGCCG 74
Query 75 GATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTTTTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAA 148
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 AATCTTCATTGGCACCTTTAAGGCTTTTGACAAGCATATGAATTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAGTTCAGAA 148
Query 149 AGATCAAGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAAGCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGG 222
||||||||||||||||..|.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 149 AGATCAAGCCAAAGAATGCGAAGCAACCAGAGCGTGAAGAAAAGCGGGTTTTGGGTCTGGTGTTGCTGCGTGGG 222
Query 223 GAGAATCTGGTCTCAATGACAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGATACTGGTATTGCTCGAGTTCCACTTGCTGG 296
|||||..||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GAGAACTTGGTATCCATGACTGTGGAGGGGCCACCCCCCAAAGATACTGGCATTGCTCGGGTACCACTTGCTGG 296
Query 297 AGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGGCAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTC 370
||||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 297 AGCTGCTGGAGGCCCTGGGGTTGGTAGGGCAGCTGGTAGAGGAGTACCAGCTGGTGTGCCAATTCCCCAGGCCC 370
Query 371 CTGCAGGACTTGCTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAGGTGATGACCCCACAAGGAAGAGGT 444
||||.|||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 CTGCTGGATTGGCAGGCCCTGTCCGAGGAGTTGGGGGACCATCCCAGCAGGTAATGACTCCACAGGGAAGAGGC 444
Query 445 ACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCACAGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGG 518
|||||.|||||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445 ACTGTAGCAGCTGCTGCTGTTGCTGCGACTGCCAGTATTGCTGGAGCCCCAACACAGTACCCACCAGGACGGGG 518
Query 519 GGGTCCTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAGGCATGATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTC 592
...|||.||||||||..|.|||.|||.|.|.||.|||||||||||.||||..||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 CACTCCGCCCCCACCCGTCGGCAGAGCAACCCCACCTCCAGGCATTATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCAC 592
Query 593 CTATGGGTCCCCCAATGGGGATCCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGCCT 666
|.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||...|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.|.||.
Sbjct 593 CCATGGGCCCACCAATTGGGCTTCCCCCTGCTCGAGGGACGCCAATAGGCATGCCGCCTCCGGGAATGAGACCC 666
Query 667 CCTCCCCCTGGGATGCGAGGCCTTCTT--------------------------- 693
|||||.||.||.||..||||.|..|.|
Sbjct 667 CCTCCACCAGGCATTAGAGGTCCACCTCCCCCAGGAATGCGTCCACCAAGACCT 720