Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01591
• Subject: NM_001190906.2
• Aligned Length: 978
• Identities: 855
• Gaps: 123

Alignment

Query   1  ATGGATCTCAGTGCTGCAAGTCACCGCATACCTCTAAGTGATGGAAACAGCATTCCCATCATCGGACTTGGTAC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATCTCAGTGCTGCAAGTCACCGCATACCTCTAAGTGATGGAAACAGCATTCCCATCATCGGACTTGGTAC  74

Query  75  CTACTCAGAACCTAAATCGACCCCTAAGGGAGCCTGTGCAACATCGGTGAAGGTTGCTATTGACACAGGGTACC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CTACTCAGAACCTAAATCGACCCCTAAGGGAGCCTGTGCAACATCGGTGAAGGTTGCTATTGACACAGGGTACC  148

Query 149  GACATATTGATGGGGCCTACATCTACCAAAATGAACACGAAGTTGGGGAGGCCATCAGGGAGAAGATAGCAGAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GACATATTGATGGGGCCTACATCTACCAAAATGAACACGAAGTTGGGGAGGCCATCAGGGAGAAGATAGCAGAA  222

Query 223  GGAAAGGTGCGGAGGGAAGATATCTTCTACTGTGGAAAGCTATGGGCTACAAATCATGTCCCAGAGATGGTCCG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAAAGGTGCGGAGGGAAGATATCTTCTACTGTGGAAAGCTATGGGCTACAAATCATGTCCCAGAGATGGTCCG  296

Query 297  CCCAACCCTGGAGAGGACACTCAGGGTCCTCCAGCTAGATTATGTGGATCTTTACATCATTGAAGTACCCATGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CCCAACCCTGGAGAGGACACTCAGGGTCCTCCAGCTAGATTATGTGGATCTTTACATCATTGAAGTACCCATGG  370

Query 371  CCTTTAAGCCAGGAGATGAAATATACCCTAGAGATGAGAATGGCAAATGGTTATATCACAAGTCAAATCTGTGT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CCTTTAAGCCAGGAGATGAAATATACCCTAGAGATGAGAATGGCAAATGGTTATATCACAAGTCAAATCTGTGT  444

Query 445  GCCACTTGGGAGGCGATGGAAGCTTGCAAAGACGCTGGCTTGGTGAAATCCCTGGGAGTGTCCAATTTTAACCG  518
           ||||||||||                                                                
Sbjct 445  GCCACTTGGG----------------------------------------------------------------  454

Query 519  CAGGCAGCTGGAGCTCATCCTGAACAAGCCAGGACTCAAACACAAGCCAGTCAGCAACCAGGTTGAGTGCCATC  592
                                                                      |||||||||||||||
Sbjct 455  -----------------------------------------------------------AGGTTGAGTGCCATC  469

Query 593  CGTATTTCACCCAGCCAAAACTCTTGAAATTTTGCCAACAACATGACATTGTCATTACTGCATATAGCCCTTTG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470  CGTATTTCACCCAGCCAAAACTCTTGAAATTTTGCCAACAACATGACATTGTCATTACTGCATATAGCCCTTTG  543

Query 667  GGGACCAGTAGGAATCCAATCTGGGTGAATGTTTCTTCTCCACCTTTGTTAAAGGATGCACTTCTAAACTCATT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544  GGGACCAGTAGGAATCCAATCTGGGTGAATGTTTCTTCTCCACCTTTGTTAAAGGATGCACTTCTAAACTCATT  617

Query 741  GGGGAAAAGGTACAATAAGACAGCAGCTCAAATTGTTTTGCGTTTCAACATCCAGCGAGGGGTGGTTGTCATTC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618  GGGGAAAAGGTACAATAAGACAGCAGCTCAAATTGTTTTGCGTTTCAACATCCAGCGAGGGGTGGTTGTCATTC  691

Query 815  CTAAAAGCTTTAATCTTGAAAGGATCAAAGAAAATTTTCAGATCTTTGACTTTTCTCTCACTGAAGAAGAAATG  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692  CTAAAAGCTTTAATCTTGAAAGGATCAAAGAAAATTTTCAGATCTTTGACTTTTCTCTCACTGAAGAAGAAATG  765

Query 889  AAGGACATTGAAGCCTTGAATAAAAATGTCCGCTTTGTAGAATTGCTCATGTGGCGCGATCATCCTGAATACCC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766  AAGGACATTGAAGCCTTGAATAAAAATGTCCGCTTTGTAGAATTGCTCATGTGGCGCGATCATCCTGAATACCC  839

Query 963  ATTTCATGATGAATAC  978
           ||||||||||||||||
Sbjct 840  ATTTCATGATGAATAC  855