Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01711
Subject:
NM_003301.6
Aligned Length:
1194
Identities:
1194
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGAAAACGAGACAGTCAGTGAACTGAACCAAACACAGCTTCAGCCACGAGCAGTGGTGGCCTTAGAATACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAACGAGACAGTCAGTGAACTGAACCAAACACAGCTTCAGCCACGAGCAGTGGTGGCCTTAGAATACCA  74

Query   75  GGTGGTCACCATCTTACTTGTACTCATTATTTGTGGCCTGGGCATTGTAGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGTCACCATCTTACTTGTACTCATTATTTGTGGCCTGGGCATTGTAGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTTG  148

Query  149  TCATGAGAACCAAGCACATGAGGACCCCCACAAACTGCTACCTGGTGAGCCTGGCAGTAGCTGATCTCATGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGAGAACCAAGCACATGAGGACCCCCACAAACTGCTACCTGGTGAGCCTGGCAGTAGCTGATCTCATGGTC  222

Query  223  TTGGTGGCCGCAGGCCTCCCCAACATAACAGACAGTATCTACGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGATGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGTGGCCGCAGGCCTCCCCAACATAACAGACAGTATCTACGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGATGCCT  296

Query  297  CTGCATTACTTACCTCCAGTATTTGGGAATTAATGCATCCTCTTGTTCAATAACAGCCTTTACCATTGAGAGGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCATTACTTACCTCCAGTATTTGGGAATTAATGCATCCTCTTGTTCAATAACAGCCTTTACCATTGAGAGGT  370

Query  371  ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACATTTTCCAGAGCCAAAAAGATTATCATCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACATTTTCCAGAGCCAAAAAGATTATCATCTTT  444

Query  445  GTCTGGGCTTTCACATCTCTTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCTTGCTGGATCTCAATATTAGCACCTACAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTGGGCTTTCACATCTCTTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCTTGCTGGATCTCAATATTAGCACCTACAAAGA  518

Query  519  TGCTATTGTGATATCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAATTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTATTGTGATATCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAATTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG  592

Query  593  TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCTACCGTCCTCTATGGATTCATAGCTAGAATCCTTTTCTTAAATCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCTACCGTCCTCTATGGATTCATAGCTAGAATCCTTTTCTTAAATCCC  666

Query  667  ATTCCTTCAGATCCTAAAGAAAACTCTAAGACATGGAAAAATGATTCAACCCATCAGAACACAAATCTGAATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCCTTCAGATCCTAAAGAAAACTCTAAGACATGGAAAAATGATTCAACCCATCAGAACACAAATCTGAATGT  740

Query  741  AAATACCTCTAATAGATGTTTCAACAGCACAGTATCTTCAAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTGGCAGTGGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAATACCTCTAATAGATGTTTCAACAGCACAGTATCTTCAAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTGGCAGTGGTTG  814

Query  815  TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTAGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGTCCTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTAGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGTCCTTTC  888

Query  889  CAAGAAAATTGGTTTTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCGGTGATTTACAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGAAAATTGGTTTTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCGGTGATTTACAA  962

Query  963  TCTCATGTCCCAGAAATTCCGTGCAGCCTTCAGAAAGCTCTGCAACTGCAAGCAGAAGCCAACAGAGAAACCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCATGTCCCAGAAATTCCGTGCAGCCTTCAGAAAGCTCTGCAACTGCAAGCAGAAGCCAACAGAGAAACCTG  1036

Query 1037  CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGCGTCATCAAGGAGTCAGACCATTTCAGCACAGAGCTTGATGATATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGCGTCATCAAGGAGTCAGACCATTTCAGCACAGAGCTTGATGATATC  1110

Query 1111  ACTGTCACTGACACTTACCTGTCTGCCACAAAAGTGTCTTTTGATGACACCTGCTTGGCTTCTGAGGTATCCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGTCACTGACACTTACCTGTCTGCCACAAAAGTGTCTTTTGATGACACCTGCTTGGCTTCTGAGGTATCCTT  1184

Query 1185  TAGCCAAAGT  1194
            ||||||||||
Sbjct 1185  TAGCCAAAGT  1194