Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01719
• Subject: NM_001330530.2
• Aligned Length: 1242
• Identities: 1161
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAA-------------------------------------  259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACATTTTGTTGTGTGCTGTCTCTGGATTCCTTTGGTGC  296

Query  260  --------------------------------------------CTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAG  289
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTTGGGAAGTCAGCTGCCCAACTGTTCATAGCACTGGCAACCTCTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAG  370

Query  290  CCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAG  444

Query  364  ACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGG  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGG  518

Query  438  AGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGG  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGG  592

Query  512  CTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACAT  666

Query  586  CATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGAT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGAT  740

Query  660  CTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGG  814

Query  734  CCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAG  888

Query  808  GAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGA  962

Query  882  CAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACA  1036

Query  956  TCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTAC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTAC  1110

Query 1030  GAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTA  1184

Query 1104  TGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1242