Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01719
Subject:
NM_001330531.2
Aligned Length:
1161
Identities:
729
Gaps:
432

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
                                                                          ||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGGGAGATGGG  12

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  86

Query  519  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  160

Query  593  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  234

Query  667  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  308

Query  741  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  382

Query  815  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  456

Query  889  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  530

Query  963  CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGC  604

Query 1037  ACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  ACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGG  678

Query 1111  AGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  AGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  729