Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01719
• Subject: NM_201357.2
• Aligned Length: 1162
• Identities: 1011
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
            |||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAAGACGACGCCCCGGTGATTTACGGGCTGGAATTCCAGGCACGTGCTCTAACACCTCAAACTGCGGAAAC  74

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct   75  AGATGCCATTCGCTTCTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCACATCATAGACTTTGATG  148

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct  149  ACGAAAATAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAGATCTGGCACATCAGTGCCAGCCCG  222

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
            |||||.|.||||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||||...|||||.|.|.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCAGATAAAGGTGTGCTGGCCACCTGCTACAACAAAACTACAGACAGTCGAGTCCAGGCGTGTGCAGCTGTGTG  296

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
            |||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GAGGATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCAGACCCTGG  370

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGGGGGATGGG  444

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  518
            |||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  518

Query  519  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  592
            ||||||||||||..|.||||||||.|.||||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  519  GGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAGGGGACAGCTGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACT  592

Query  593  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  666
            |.|||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  GTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACACGACCCTCCGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGC  666

Query  667  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  740
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct  667  ATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTGCGTGACCTAGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTG  740

Query  741  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  814
            .|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTGGGACACACGGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  814

Query  815  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  888
            |||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  815  CCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACAACCACTCTCACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGA  888

Query  889  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  962
            ||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  889  GTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATCTCCTCAGAGCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGA  962

Query  963  -CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAG  1035
             ||| ||.||.||||.|.|||||   |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  963  TCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---AAGAGCAAGGAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAG  1032

Query 1036  CACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGG  1109
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1033  CATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGACTGGGCCTCAGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGG  1106

Query 1110  GAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            |||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1107  GAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAGGGCACTGAAGTACCACATACTGCTC  1158