Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01719
• Subject: XM_006515120.3
• Aligned Length: 1201
• Identities: 1011
• Gaps: 44

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
            |||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAAGACGACGCCCCGGTGATTTACGGGCTGGAATTCCAGGCACGTGCTCTAACACCTCAAACTGCGGAAAC  74

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct   75  AGATGCCATTCGCTTCTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCACATCATAGACTTTGATG  148

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct  149  ACGAAAATAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAGATCTGGCACATCAGTGCCAGCCCG  222

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
            |||||.|.||||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||||...|||||.|.|.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCAGATAAAGGTGTGCTGGCCACCTGCTACAACAAAACTACAGACAGTCGAGTCCAGGCGTGTGCAGCTGTGTG  296

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
            |||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GAGGATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCAGACCCTGG  370

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGGGGGATGGG  444

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGT---  515
            |||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...|||||||||||||||||   
Sbjct  445  AAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAGGCTGTGAT  518

Query  516  ------------------------------------GCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAAC  553
                                                |||||||||||||||..|.||||||||.|.||||||.|
Sbjct  519  CTTTCTTCTCTCCTTTGAACAATACCCGTTCTACCAGCTGGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAGGGGACAGC  592

Query  554  TGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTC  627
            |||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||||||
Sbjct  593  TGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACTGTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACACGACCCTC  666

Query  628  CGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCT  701
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  CGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGCATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTGCGTGACCT  740

Query  702  TGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCC  775
            .|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  AGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTGTGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTGGGACACAC  814

Query  776  GAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCT  849
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACAACCACTCT  888

Query  850  CATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGA  923
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct  889  CACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGAGTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATCTCCTCAGA  962

Query  924  GCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA-CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAG  996
            ||||||.||.|||.||||.|||||||.|||||||||||| ||| ||.||.||||.|.|||||   |||||||||
Sbjct  963  GCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGATCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---AAGAGCAAG  1032

Query  997  GAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTC  1070
            ||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct 1033  GAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAGCATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGACTGGGCCTC  1106

Query 1071  GGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGA  1144
            .||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1107  AGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGGGAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAGGGCACTGA  1180

Query 1145  AGTACCACATCCTGCTA  1161
            ||||||||||.|||||.
Sbjct 1181  AGTACCACATACTGCTC  1197