Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01719
- Subject:
- XM_006515121.3
- Aligned Length:
- 1283
- Identities:
- 857
- Gaps:
- 298
Alignment
Query 1 ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT 222
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1 ------------------------ATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAGATCTGGCACATCAGTGCCAGCCCG 50
Query 223 GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAA-------------------------CTTCAGACAGCA 271
|||||.|.||||||||||.|.|||||||||||||.|| ||||.|.|||||
Sbjct 51 GCAGATAAAGGTGTGCTGGCCACCTGCTACAACAAAAGAAAGCATGAAGCAGCTGGTCTCAGCTTCTGCCAGCA 124
Query 272 A---------------------------------------------------------AGTCCTGACATGTGCA 288
| |||||.|.|.||||||
Sbjct 125 AGTGTGGGTGCTGTGGAGGCTGCAGCATGCCTTCACTCAATCAAGCTACAGACAGTCGAGTCCAGGCGTGTGCA 198
Query 289 GCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACA 362
||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||
Sbjct 199 GCTGTGTGGAGGATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCA 272
Query 363 GACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGG 436
|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 273 GACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGG 346
Query 437 GAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAG 510
|.|||||||||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...||||||||||||
Sbjct 347 GGGATGGGAAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAG 420
Query 511 GCTGT---------------------------------------GCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAA 545
||||| |||||||||||||||..|.||||||||.|.
Sbjct 421 GCTGTGATCTTTCTTCTCTCCTTTGAACAATACCCGTTCTACCAGCTGGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAG 494
Query 546 GGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACA 619
||||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|..||||
Sbjct 495 GGGACAGCTGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACTGTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACA 568
Query 620 CCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTG 693
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 569 CGACCCTCCGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGCATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTG 642
Query 694 CGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTG 767
||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 643 CGTGACCTAGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTGTGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTG 716
Query 768 GGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACA 841
||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||
Sbjct 717 GGACACACGGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACA 790
Query 842 ACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATC 915
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 791 ACCACTCTCACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGAGTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATC 864
Query 916 TCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA-CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGA 988
||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||.|||||||||||| ||| ||.||.||||.|.||||| |
Sbjct 865 TCCTCAGAGCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGATCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---A 934
Query 989 AGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGAC 1062
||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 935 AGAGCAAGGAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAGCATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGAC 1008
Query 1063 TGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAG 1136
|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1009 TGGGCCTCAGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGGGAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAG 1082
Query 1137 GGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA 1161
|||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1083 GGCACTGAAGTACCACATACTGCTC 1107