Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01719
• Subject: XM_006515122.1
• Aligned Length: 1162
• Identities: 746
• Gaps: 305

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
                |||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||||
Sbjct    1  ----ATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCAGACCCTGG  70

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct   71  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGGGGGATGGG  144

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  518
            |||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...||||||||||||||||||||
Sbjct  145  AAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  218

Query  519  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  592
            ||||||||||||..|.||||||||.|.||||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  219  GGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAGGGGACAGCTGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACT  292

Query  593  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  666
            |.|||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  293  GTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACACGACCCTCCGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGC  366

Query  667  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  740
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct  367  ATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTGCGTGACCTAGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTG  440

Query  741  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  814
            .|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  TGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTGGGACACACGGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  514

Query  815  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  888
            |||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  515  CCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACAACCACTCTCACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGA  588

Query  889  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  962
            ||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  589  GTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATCTCCTCAGAGCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGA  662

Query  963  -CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAG  1035
             ||| ||.||.||||.|.|||||   |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  663  TCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---AAGAGCAAGGAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAG  732

Query 1036  CACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGG  1109
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  733  CATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGACTGGGCCTCAGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGG  806

Query 1110  GAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            |||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  807  GAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAGGGCACTGAAGTACCACATACTGCTC  858