Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01719
• Subject: XM_011510383.3
• Aligned Length: 1280
• Identities: 1147
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  -------------ATGGAGGACGATGCACC--------AG-----TGATCTACG------GGCTGGAG------  36
                         ||..|||| ||..|.||        ||     |.|||||.|      .|| .|||      
Sbjct    1  ATGCGATTAAATAATCCAGGA-GAGCCTCCTCATCTCAAGGTCCTTAATCTAAGCACATCAGC-AGAGTCCCTT  72

Query   37  TTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT  110
            |.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TACCGCGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT  146

Query  111  TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC  220

Query  185  ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA  294

Query  259  A-------------------------------------------------------------------------  259
            |                                                                         
Sbjct  295  ACATTTTGTTGTGTGCTGTCTCTGGATTCCTTTGGTGCTCTTGGGAAGTCAGCTGCCCAACTGTTCATAGCACT  368

Query  260  --------CTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCA  325
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  GGCAACCTCTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCA  442

Query  326  GCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCC  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  GCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCC  516

Query  400  CATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCA  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  CATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCA  590

Query  474  TATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGG  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGG  664

Query  548  GACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACC  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  GACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACC  738

Query  622  ACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCG  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  ACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCG  812

Query  696  GGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGG  886

Query  770  ACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAAC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAAC  960

Query  844  CACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTC  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTC  1034

Query  918  GTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGA  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGA  1108

Query  992  GCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  GCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGG  1182

Query 1066  TCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGC  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  TCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGC  1256

Query 1140  CCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  CCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1278