Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01719
- Subject:
- XM_011510385.2
- Aligned Length:
- 1199
- Identities:
- 1147
- Gaps:
- 40
Alignment
Query 1 -------------ATGGAGGACGATGCACC--------AG-----TGATCTACG------GGCTGGAG------ 36
||..|||| ||..|.|| || |.|||||.| .|| .|||
Sbjct 1 ATGCGATTAAATAATCCAGGA-GAGCCTCCTCATCTCAAGGTCCTTAATCTAAGCACATCAGC-AGAGTCCCTT 72
Query 37 TTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT 110
|.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TACCGCGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT 146
Query 111 TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC 220
Query 185 ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA 294
Query 259 ACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGA 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 ACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGA 368
Query 333 GTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCA 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCA 442
Query 407 ACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 ACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTG 516
Query 481 CTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACT 590
Query 555 GAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCC 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCC 664
Query 629 GTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTT 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 GTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTT 738
Query 703 GACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCG 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCG 812
Query 777 AAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTC 886
Query 851 ATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAG 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 ATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAG 960
Query 925 CCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGA 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGA 1034
Query 999 GCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGG 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGG 1108
Query 1073 CTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAG 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAG 1182
Query 1147 TACCACATCCTGCTA 1161
|||||||||||||||
Sbjct 1183 TACCACATCCTGCTA 1197