Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01722
• Subject: NM_003315.4
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1314
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT  148

Query    1  --------------------ATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  54
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  222

Query   55  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  296

Query  129  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  370

Query  203  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  444

Query  277  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  518

Query  351  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  592

Query  425  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  666

Query  499  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  740

Query  573  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  814

Query  647  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  888

Query  721  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  962

Query  795  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  1036

Query  869  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  1110

Query  943  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1184

Query 1017  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1258

Query 1091  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1332

Query 1165  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1406

Query 1239  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1480

Query 1313  GC  1314
            ||
Sbjct 1481  GC  1482