Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01722
- Subject:
- NM_019795.4
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1209
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCTACCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCTGAACTGCTGGAGGACGAAGACGCCAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAGGGAAGCAGAATCCTTCAAGGAACAAGGGAATGCATATTATGCTAAGAAGGACTACAACGAAGCTTATAACT 148
Query 1 --------------------ATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 54
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct 149 ATTACACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAACAATGCCAGCTATTACGGTAATCGAGCGGCCACACTGATGATG 222
Query 55 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 128
||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTGGACGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCGCAGCAGTCTGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 296
Query 129 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 202
.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 CCTCCGAGAAGGCAAGTGCCACCTCTCACTTGGGAATGCAATGGCGGCATGTCGTAGTTTCCAAAGAGCCCTAG 370
Query 203 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 276
|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AACTGGATCATAAAAATGCCCAGGCACAGCAGGAGTTCAAGAACGCCAATGCCGTCATGGAGTATGAGAAAATA 444
Query 277 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 350
||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGAAGTGGATTTTGAAAAGCGAGATTTCCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 518
Query 351 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 424
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||
Sbjct 519 TGCCTGCCATCGATTCAAAATTCTCAAAGCAGAATGTTTAGCAATGCTTGGTCGATACCCAGAAGCACAGTTTG 592
Query 425 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 498
||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCCAGTGACATTTTACGAATGGATTCCACCAATGCTGATGCTCTGTATGTCCGGGGTCTTTGCCTTTATTAC 666
Query 499 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 572
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTGCAGTTTTTTGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCTTG 740
Query 573 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 646
..|.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTCGCTTGTAGAAATGCCAAAGCCCTTAAAGCCAAGAAGGAAGATGGGAATAAAGCCTTTAAGGAAGGAAATT 814
Query 647 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 720
||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAAGCTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCTTGGGGATAGATCCCAACAACATAAAAACAAATGCTAAACTC 888
Query 721 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGCAACTGGAAGATGCCATAGAAGACTGTACAAATGCGGT 962
Query 795 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 868
||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 963 GAAGCTCGATGACACTTACATCAAAGCCTACCTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAGCAGTTTGAAG 1036
Query 869 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 942
||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 AAGCCGTGCGGGACTATGAAAAAGTGTATCAGACGGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTTAAGAATGCA 1110
Query 943 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1016
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGCAAGAGGAAAGATTACTACAAGATCCTGGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1184
Query 1017 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1090
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185 CGAGATCAAGAAAGCTTACCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCACAGTGGGGCCAGTGCCGAAG 1258
Query 1091 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1164
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTTAAGGAAGTGGGAGAGGCCTTTACCATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1332
Query 1165 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1238
|||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1333 ACTCGTTATGACAGTGGACAGGACTTGGATGAGGAGGGCATGAATATGGGCGATTTTGATGCAAACAACATCTT 1406
Query 1239 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1312
||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||
Sbjct 1407 CAAGGCATTCTTCGGTGGTCCTGGGGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGCCCAGGGAATTTCTACTTTCAGTTTG 1480
Query 1313 GC 1314
||
Sbjct 1481 GC 1482