Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01722
- Subject:
- NR_029431.1
- Aligned Length:
- 2007
- Identities:
- 1314
- Gaps:
- 693
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGCCCTAGAGAGGCTACCACCGGTACACCCCGCCTTCCCACCCACGGGTAAAGTGGCGCCGCCTACGCACCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CACAGCCCCTGGGCTCCCGCCCCGGCGCGGAGACCACCGTGGACATCCGGGGGCGGGAGGCCGCTCTGGCCCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCGGAGCCTCTCTCTGGTAGACGAGCCCGAGGGAGCCCTTCTGGGCGCGGCGCCGCGGAGCTGCTCTATGCTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CAACCGGAAGTGCTCTTCACCGCCGGCCTCCCACCCAGCTCTCTGGTCCCGGCGGTAAGATGGCGGCTGCCGCG 296
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGTGTCCTA 10
||||||||||
Sbjct 297 GAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGATATGTGTCCTA 370
Query 11 AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT 84
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT 444
Query 85 GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT 518
Query 159 GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC 592
Query 233 AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT 666
Query 307 CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC 740
Query 381 AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA 454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA 814
Query 455 CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT 888
Query 529 TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA 962
Query 603 AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG 1036
Query 677 CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG 1110
Query 751 CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA 1184
Query 825 CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC 1258
Query 899 AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA 1332
Query 973 GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC 1406
Query 1047 CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG 1480
Query 1121 AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT 1554
Query 1195 GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT 1628
Query 1269 CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC---------------------------- 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGCTAATGAAGGGCAACCACCCAGAACCCAG 1702
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1703 AAAATGCAGATTCACTCAGTTTAATCTTGAATGTGGAAACAGTTCACCTCCTCCCTTCATCACGTCTCCGTGTG 1776
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1777 CTTAGAGCAGTTTCGTTTTCTCAGTTGGATGCCCTGTGTCTCTGTGAGTGGGGTGGAGCAAAGGGAACCAATGC 1850
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1851 CGAAGACCGAGGGCAGGGGAGGGAGGCGGGGGTGGACAGGGAGGCAGCTTGTGAATTTTTGTTTTACTGTTTAA 1924
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1925 CTTTATTAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGAATAAAATGTTTTGACCCTTCCTGGCCCTTTGCTCTGGAAAAAAAAA 1998
Query 1315 --------- 1314
Sbjct 1999 AAAAAAAAA 2007