Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01728
- Subject:
- XM_011527254.2
- Aligned Length:
- 1593
- Identities:
- 1461
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT 74
Query 75 GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC 148
Query 149 CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC 222
Query 223 CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG 296
Query 297 TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC 370
Query 371 AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC 444
Query 445 GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC 518
Query 519 CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG 592
Query 593 GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC 666
Query 667 TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG 740
Query 741 CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA 814
Query 815 TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC 888
Query 889 GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC 962
Query 963 TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG 1036
Query 1037 GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT 1110
Query 1111 CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTT---------- 1174
Query 1185 CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA 1258
Sbjct 1175 -------------------------------------------------------------------------- 1174
Query 1259 ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 ---------------ATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG 1233
Query 1333 TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG 1307
Query 1407 GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACC--------------------------------- 1447
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCGTGAGCTCCTGGAAACCAGTTTAGCCGGGCCAG 1381
Query 1448 AAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGC 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 AAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGC 1455
Query 1522 CCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGTTTCAAT 1560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456 CCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGTTTCAAT 1494