Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01728
- Subject:
- XM_024451682.1
- Aligned Length:
- 1560
- Identities:
- 1494
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT 74
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGAGGCTGCAGAAGCT 17
Query 75 GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC 91
Query 149 CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 92 CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTT---------AGGCCTTGGGAAC 156
Query 223 CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG 230
Query 297 TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC 304
Query 371 AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC 378
Query 445 GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC 452
Query 519 CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG 526
Query 593 GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC 600
Query 667 TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG 674
Query 741 CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA 748
Query 815 TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC 822
Query 889 GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC 896
Query 963 TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG 970
Query 1037 GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT 1044
Query 1111 CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA 1118
Query 1185 CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA 1192
Query 1259 ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG 1266
Query 1333 TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG 1340
Query 1407 GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG 1414
Query 1481 GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT 1488
Query 1555 TTCAAT 1560
||||||
Sbjct 1489 TTCAAT 1494