Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01728
• Subject: XM_024451683.1
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1404
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT  74
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGAGGCTGCAGAAGCT  17

Query   75  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  91

Query  149  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC  165

Query  223  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  239

Query  297  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  313

Query  371  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  387

Query  445  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  461

Query  519  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  535

Query  593  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  609

Query  667  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  683

Query  741  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  757

Query  815  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  831

Query  889  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  905

Query  963  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  979

Query 1037  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1053

Query 1111  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1054  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTT----------  1117

Query 1185  CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA  1258
                                                                                      
Sbjct 1118  --------------------------------------------------------------------------  1117

Query 1259  ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1332
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118  ---------------ATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1176

Query 1333  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1250

Query 1407  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG  1324

Query 1481  GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT  1398

Query 1555  TTCAAT  1560
            ||||||
Sbjct 1399  TTCAAT  1404