Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01728
• Subject: XR_935852.2
• Aligned Length: 1908
• Identities: 1346
• Gaps: 562

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TTTGTTGGAAGTGGAGAGTGGAGGGTCAGAAGGGAGTGGACCAGTTCAGGTCCCAGAGGGAATCCTCCCTCCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGAGCCGTCTTTCTTCTCCTCCCTATTTCGCAGATATCCCGAGATTAGGTCCCCAGCTTCCAAAGAGAGGATC  148

Query    1  ---ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAA  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAA  222

Query   72  GCTGGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCA  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCA  296

Query  146  ATCCTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGG  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCCTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGG  370

Query  220  AACCCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAG  444

Query  294  CTGTGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGTGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTC  518

Query  368  TCCAGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGT  592

Query  442  TCCGTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCGTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGG  666

Query  516  GACCCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACC  740

Query  590  CTGGAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAG  814

Query  664  GCCTCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGG  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGG  888

Query  738  TGGCACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGCACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGG  962

Query  812  ACATGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCAC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACATGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCAC  1036

Query  886  GGCGTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCGTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCT  1110

Query  960  GGCTGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGG  1184

Query 1034  ACGGGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1185  ACGGGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAG----------------------------------------------  1212

Query 1108  AATCCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCC  1181
                                                                                      
Sbjct 1213  --------------------------------------------------------------------------  1212

Query 1182  CAACGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAA  1255
                                                                                      
Sbjct 1213  --------------------------------------------------------------------------  1212

Query 1256  TCAATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTT  1329
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  --------------------GAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTT  1266

Query 1330  TTGTTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCAC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  TTGTTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCAC  1340

Query 1404  TCGGGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  TCGGGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAG  1414

Query 1478  TGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCC  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  TGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCC  1488

Query 1552  AGTTTCAAT-----------------------------------------------------------------  1560
            |||||||||                                                                 
Sbjct 1489  AGTTTCAATTAGAAGCTGGCTGTTGAATAACTCAATAAAATACCATACCCTTGCCAGCTTCTGTGCCTCCTCAT  1562

Query 1561  --------------------------------------------------------------------------  1560
                                                                                      
Sbjct 1563  TTGGAGGAAGGGCCCCGACATGCCTTCTTTTGCACCACCTTAATAACCAACACTGACCGGGCAAGGTGGCTCAC  1636

Query 1561  ----------------------------------------------------------  1560
                                                                      
Sbjct 1637  GCCTGTAATCCCAACACTTTGGCAGGCTGAAGCTGGTGCATCACCTGAAGTCAGGAGA  1694