Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01748
Subject:
XM_006522007.3
Aligned Length:
921
Identities:
700
Gaps:
129

Alignment

Query   1  ATGTTCTCTTTCAACATGTTCGACCACCCTATTCCCAGGGTCTTCCAAAACCGCTTCTCCACACAGTACCGCTG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CTTCTCTGTGTCCATGCTAGCAGGGCCTAATGACAGGTCAGATGTGGAGAAAGGAGGGAAGATAATTATGCCAC  148
                                        |||||||                          ||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------ATGACAG--------------------------TAATTATGCCAC  19

Query 149  CCTCGGCCCTGGACCAACTCAGCCGACTTAACATTACCTATCCCATGCTGTTCAAACTGACCAATAAGAATTCG  222
           ||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct  20  CCTCAGCCCTCGATCAACTCAGCCGGCTCAACATTACCTATCCTATGCTGTTTAAATTGACCAATAAGAATTCA  93

Query 223  GACCGCATGACGCATTGTGGCGTGCTGGAGTTTGTGGCTGATGAGGGCATCTGCTACCTCCCACACTGGATGAT  296
           ||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  94  GATCGGATGACACACTGCGGTGTACTGGAGTTTGTTGCTGATGAAGGCATCTGTTACCTCCCCCACTGGATGAT  167

Query 297  GCAGAACTTACTCTTGGAAGAAGGCGGCCTGGTCCAGGTGGAGAGCGTCAACCTTCAAGTGGCCACCTACTCCA  370
           ||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 168  GCAGAATTTGCTGTTGGAGGAAGGGGGCCTGGTTCAGGTGGAAAGTGTCAACCTCCAAGTGGCGACCTACTCTA  241

Query 371  AATTCCAACCTCAGAGCCCTGACTTCCTGGACATCACCAACCCCAAAGCCGTATTAGAAAACGCACTTAGGAAC  444
           |.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.||.|||
Sbjct 242  AGTTCCAGCCTCAGAGCCCAGACTTCCTGGATATTACCAACCCTAAAGCGGTATTAGAAAATGCATTGAGAAAC  315

Query 445  TTTGCCTGTCTGACCACCGGGGATGTGATTGCCATCAACTATAATGAAAAGATCTACGAACTGCGTGTGATGGA  518
           ||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 316  TTCGCCTGTCTGACGACTGGAGATGTGATTGCTATCAACTACAATGAGAAGATCTATGAGCTGCGGGTGATGGA  389

Query 519  GACCAAACCCGACAAGGCAGTGTCCATCATTGAGTGTGACATGAACGTGGACTTTGATGCTCCCCTGGGCTACA  592
           |||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct 390  GACCAAACCTGACAAGGCTGTATCCATTATTGAATGTGACATGAATGTGGATTTTGATGCTCCCTTGGGATACA  463

Query 593  AAGAACCCGAAAGACAAGTCCAGCATGAGGAGTCGACAGAAGGTGAAGCCGACCACAGTGGCTATGCTGGAGAG  666
           |||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.|.|||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 464  AAGAACCAGAAAGACCAGTGCAGCATGAGGAGTCAATAGAGGGAGAAGCTGACCACAGTGGCTATGCCGGAGAG  537

Query 667  CTGGGCTTCCGCGCTTTCTCTGGATCTGGCAATAGACTGGATGGAAAGAAGAAAGGGGTAGAGCCCAGCCCCTC  740
           .||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 538  GTGGGCTTCCGTGCCTTCTCTGGTTCTGGGAATAGACTGGATGGGAAGAAAAAAGGGGTTGAGCCCAGTCCCTC  611

Query 741  CCCAATCAAGCCTGGAGATATTAAAAGAGGAATTCCCAATTATGAATTTAAACTTGGTAAGATAACTTTCATCA  814
           ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 612  CCCAATCAAGCCTGGAGACATCAAAAGAGGAATTCCTAATTACGAATTTAAGCTTGGTAAGATCACTTTCATCA  685

Query 815  GAAATTCACGTCCCCTTGTCAAAAAGGTTGAAGAGGATGAAGCTGGAGGCAGATTCGTCGCTTTCTCTGGAGAA  888
           |||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 686  GAAATTCACGTCCATTGGTCAAAAAGGTTGAAGAGGATGAAGCTGGAGGCAGATTCATTGCTTTCTCTGGAGAA  759

Query 889  GGACAGTCATTGCGTAAAAAGGGAAGAAAGCCC  921
           |||||||||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 760  GGACAGTCACTGCGTAAGAAGGGAAGAAAGCCC  792