Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01765
• Subject: NM_001184783.2
• Aligned Length: 930
• Identities: 874
• Gaps: 51

Alignment

Query   1  -----------------------ATGGC--GACC-----CACGGACA------------GACTTGCGCGCGTC-  31
                                  ||.||  |.||     || |.|||            |||||  |.|.||| 
Sbjct   1  ATGAGCTGGTGTAATGAGCTCAGATTGCCTGCCCTTAAGCA-GCACAGCATTGGCCGAGGACTT--GAGAGTCA  71

Query  32  -----CAATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTG  100
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  72  CATTACAATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTG  145

Query 101  GTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCGTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCT  174
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146  GTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCGTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCT  219

Query 175  AATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCAC  248
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220  AATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCAC  293

Query 249  AGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAAC  322
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294  AGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAAC  367

Query 323  TGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAG  396
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368  TGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAG  441

Query 397  TGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTA  470
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  TGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTA  515

Query 471  TGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAG  544
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  TGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAG  589

Query 545  TGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTAT  618
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590  TGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTAT  663

Query 619  CAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGG  692
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664  CAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGG  737

Query 693  CATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAG  766
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738  CATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAG  811

Query 767  TAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAAT  840
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812  TAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAAT  885

Query 841  GCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  882
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886  GCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  927