Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01789
- Subject:
- XM_017018245.1
- Aligned Length:
- 1944
- Identities:
- 1613
- Gaps:
- 315
Alignment
Query 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCA-------CGCCGTTG------------GACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGA 55
||||..||||.| ||| |.||..|| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAACCGTA-------CCAAGGATAGCTCCTCTGCTTCTACAGCAAGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGA 67
Query 56 GGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGA 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 GGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGA 141
Query 130 CTTACTCGAGAACAAGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGG 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 CTTACTCGAGAACAAGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGG 215
Query 204 AGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGC 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGC 289
Query 278 GGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTT 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTT 363
Query 352 GCACTCAATCCGGATTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGAT 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCACTCAATCCGGATTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGAT 437
Query 426 TCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACA 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 TCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACA 511
Query 500 TAGAGAAGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAA 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 TAGAGAAGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAA 585
Query 574 GATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAA 659
Query 648 AAAGGCAGTGGAACAGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AAAGGCAGTGGAACAGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGA 733
Query 722 AGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGG 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 AGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGG 807
Query 796 CAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTC 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTC 881
Query 870 AGACTGTAAATTCCAAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 AGACTGTAAATTCCAAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGT 955
Query 944 CCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCC 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 CCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCC 1029
Query 1018 CTGGCCAGCGCACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAG 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 CTGGCCAGCGCACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAG 1103
Query 1092 CCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 CCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTG 1177
Query 1166 GGCCCGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATG 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 GGCCCGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATG 1251
Query 1240 CAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCC 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 CAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCC 1325
Query 1314 TCCTGGGCACCATGGCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCC 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TCCTGGGCACCATGGCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCC 1399
Query 1388 TGCATCAAGGAAAAGGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGG 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 TGCATCAAGGAAAAGGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGG 1473
Query 1462 CAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCC 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 CAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCC 1547
Query 1536 GCCCAGCAGCAGTATGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA----GA----TCCCTCCCCGCGGCGGC 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |.||.||.|| .||
Sbjct 1548 GCCCAGCAGCAGTATGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAATACGACGACTACCACCACG----AGC 1617
Query 1602 GATGG------------CCCGAGCCATG---AGAG-----------TG----AGGACTT-TCC--GCGCCCATT 1642
|.||| ||| |||||| |.|| || || ||| ||| |.||||.|.
Sbjct 1618 GCTGGCACAGGGTCCATCCC--GCCATGGCAACAGCAGCAGGCGGCTGCCGCAG--CTTCTCCAGGAGCCCCTC 1687
Query 1643 GG------------------------------------------------------------------------ 1644
.|
Sbjct 1688 AGATGCAAGGCAACCCCACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCTGGGGCCCCTCCC 1761
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1762 CCTCCGCCGCCTCCACCGCCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATGCCCCGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGA 1835
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1836 CCCTTCTAACTTTGTCACCATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGCTCCCC 1909
Query 1645 -------------------- 1644
Sbjct 1910 CACCGCCTCCACCACAGAAC 1929