Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01831
• Subject: NM_006001.3
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1140
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA  148
            |||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGGGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTTATCACAGGCAAAGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||||||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCCGACCAGTGCACGGGTCTCCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||.|..|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..|.||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATTGAGCGTCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC  666

Query  667  ACCTATACTAACCTGAATAGGTTAATAGGTCAAATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.||.||.|||||.|||.|..|.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTATCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG  962
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAACGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTTGGGGAGGGGATGGAGGAAGGTGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT  1332
            |||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGGCT  1332

Query 1333  GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC  1353
               ||||||||.||.||||||
Sbjct 1333  ---GAAGAAGGTGAAGAATAC  1350