Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01831
- Subject:
- NM_080386.4
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1143
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG 74
|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA 148
|||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 75 CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGGGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC 222
||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTTATCACAGGCAAAGAAGATGC 296
.|.||||||||.|||||.||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC 296
Query 297 TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA 370
.||||||||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 297 AGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA 370
Query 371 AGCTGGCCGACCAGTGCACGGGTCTCCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG 444
|.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG 444
Query 445 TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCC 518
|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..|.||||||||
Sbjct 445 TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC 518
Query 519 GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT 592
.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT 592
Query 593 CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATTGAGCGTCCA 666
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 593 CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC 666
Query 667 ACCTATACTAACCTGAATAGGTTAATAGGTCAAATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC 740
||.||.||.|||||.|||.|..|.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct 667 ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC 740
Query 741 CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTATCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT 814
|||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT 814
Query 815 ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT 888
|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 ATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC 888
Query 889 GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG 962
|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct 889 GAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG 962
Query 963 TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT 1036
.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGATT 1036
Query 1037 GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG 1110
Query 1111 GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT 1184
||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGTT 1184
Query 1185 TGACCTGATGTATGCCAAACGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTTGGGGAGGGGATGGAGGAAGGTGAGTTTTCAG 1258
.||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG 1258
Query 1259 AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT 1332
|||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259 AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT 1332
Query 1333 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC 1353
||||||||.||.||||||
Sbjct 1333 ---GAAGAAGGCGAAGAATAC 1350