Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01889
• Subject: NM_008055.4
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1487
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCTGGCGGGGCGCAGGGCCGAGCGTCCCGGGGGCGCCCGGGGGCGTCGGTCTCAGTCTGGGGTTGCTCCT  74
            ||||||||||.||||.|||||||||||..||.|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.||
Sbjct    1  ATGGCCTGGCCGGGCACAGGGCCGAGCAGCCGGGGGGCGCCTGGAGGCGTCGGGCTCAGGCTGGGGCTGCTGCT  74

Query   75  GCAGTTGCTGCTGCTCCTGGGGCCGGCGCGGGGCTTCGGGGACGAGGAAGAGCGGCGCTGCGACCCCATCCGCA  148
            ||||||.||.|||||||||.|||||.|.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGTTCCTCCTGCTCCTGCGGCCGACACTGGGGTTCGGGGACGAGGAGGAGCGGCGCTGCGACCCCATCCGCA  148

Query  149  TCTCCATGTGCCAGAACCTCGGCTACAACGTGACCAAGATGCCCAACCTGGTTGGGCACGAGCTGCAGACGGAC  222
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TCGCCATGTGCCAGAACCTCGGCTACAACGTGACCAAGATGCCCAACTTAGTGGGACACGAGCTGCAGACAGAC  222

Query  223  GCCGAGCTGCAGCTGACAACTTTCACACCGCTCATCCAGTACGGCTGCTCCAGCCAGCTGCAGTTCTTCCTTTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGAGCTGCAGCTGACAACTTTCACGCCGCTCATCCAGTACGGCTGCTCCAGCCAGCTGCAGTTCTTCCTTTG  296

Query  297  TTCTGTTTATGTGCCAATGTGCACAGAGAAGATCAACATCCCCATTGGCCCATGCGGCGGCATGTGTCTTTCAG  370
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  TTCGGTTTATGTGCCAATGTGCACAGAGAAGATCAACATCCCCATCGGCCCGTGCGGTGGCATGTGCCTTTCAG  370

Query  371  TCAAGAGACGCTGTGAACCCGTCCTGAAGGAATTTGGATTTGCCTGGCCAGAGAGTCTGAACTGCAGCAAATTC  444
            |||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||.||.|..||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCAAGAGACGCTGTGAACCAGTCCTGAGAGAATTTGGGTTTGCCTGGCCCGACACCCTGAACTGCAGCAAGTTC  444

Query  445  CCACCACAGAACGACCACAACCACATGTGCATGGAAGGGCCAGGTGATGAAGAGGTGCCCTTACCTCACAAAAC  518
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  445  CCGCCCCAGAACGACCACAACCACATGTGCATGGAAGGACCAGGTGATGAAGAGGTTCCCTTGCCCCACAAGAC  518

Query  519  CCCCATCCAGCCTGGGGAAGAGTGTCACTCTGTGGGAACCAATTCTGATCAGTACATCTGGGTGAAAAGGAGCC  592
            .|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TCCCATCCAGCCCGGGGAAGAGTGCCACTCCGTGGGAAGCAATTCTGATCAGTACATCTGGGTGAAGAGGAGCC  592

Query  593  TGAACTGTGTGCTCAAGTGTGGCTATGATGCTGGCTTATACAGCCGCTCAGCCAAGGAGTTCACTGATATCTGG  666
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGAACTGTGTTCTCAAGTGTGGCTACGATGCTGGCTTGTACAGCCGCTCAGCTAAGGAGTTCACGGATATTTGG  666

Query  667  ATGGCTGTGTGGGCCAGCCTGTGTTTCATCTCCACTGCCTTCACAGTACTGACCTTCCTGATCGATTCTTCTAG  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  667  ATGGCTGTGTGGGCCAGCCTCTGCTTCATCTCCACCACCTTCACCGTGCTGACCTTCCTGATTGATTCATCCAG  740

Query  741  GTTTTCCTACCCTGAGCGCCCCATCATATTTCTCAGTATGTGCTATAATATTTATAGCATTGCTTATATTGTCA  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  741  GTTTTCTTACCCTGAGCGCCCCATCATATTTCTCAGTATGTGCTATAATATTTATAGCATTGCTTATATTGTTC  814

Query  815  GGCTGACTGTAGGCCGGGAAAGGATATCCTGTGATTTTGAAGAGGCAGCAGAACCTGTTCTCATCCAAGAAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGACTGTAGGCCGGGAAAGGATATCCTGTGATTTTGAAGAGGCGGCAGAGCCCGTTCTCATCCAAGAAGGA  888

Query  889  CTTAAGAACACAGGATGTGCAATAATTTTCTTGCTGATGTACTTTTTTGGAATGGCCAGCTCCATTTGGTGGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTAAGAACACAGGATGTGCAATAATTTTCTTGCTGATGTACTTTTTTGGAATGGCCAGCTCCATTTGGTGGGT  962

Query  963  TATTCTGACACTCACTTGGTTTTTGGCAGCAGGACTCAAATGGGGTCATGAAGCCATTGAAATGCACAGCTCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  TATTCTGACACTCACTTGGTTTTTGGCAGCCGGACTCAAGTGGGGTCATGAAGCCATTGAAATGCACAGTTCTT  1036

Query 1037  ATTTCCACATTGCAGCCTGGGCCATCCCCGCAGTGAAAACCATTGTCATCTTGATTATGAGACTGGTGGATGCA  1110
            ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  ATTTCCACATCGCAGCCTGGGCTATTCCCGCAGTGAAAACCATTGTCATCTTGATTATGAGACTAGTGGATGCC  1110

Query 1111  GATGAACTGACTGGCTTGTGCTATGTTGGAAACCAAAATCTCGATGCCCTCACCGGGTTCGTGGTGGCTCCCCT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  GATGAACTGACTGGCTTGTGCTATGTTGGGAACCAAAATCTAGATGCCCTCACTGGCTTTGTGGTGGCTCCTCT  1184

Query 1185  CTTTACTTATTTGGTCATTGGAACTTTGTTCATTGCTGCAGGTTTGGTGGCCTTGTTCAAAATTCGGTCAAATC  1258
            ||||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185  CTTTACGTATTTGGTGATTGGAACGCTGTTCATTGCGGCGGGTTTGGTGGCCTTATTCAAAATCCGGTCCAATC  1258

Query 1259  TTCAAAAGGATGGGACAAAGACAGACAAGTTAGAAAGACTGATGGTCAAGATTGGGGTGTTCTCAGTACTGTAC  1332
            |||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAAAAAGACGGGACAAAGACAGACAAGTTGGAAAGGCTAATGGTCAAGATCGGGGTCTTCTCAGTACTGTAC  1332

Query 1333  ACAGTTCCTGCAACGTGTGTGATTGCCTGTTATTTTTATGAAATCTCCAACTGGGCACTTTTTCGGTATTCTGC  1406
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333  ACGGTTCCTGCAACCTGTGTGATTGCCTGTTATTTCTATGAAATCTCAAACTGGGCACTCTTTCGATATTCTGC  1406

Query 1407  AGATGATTCCAACATGGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTTATGTCTTTGTTGGTGGGCATCACTTCAGGCATGT  1480
            ||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGATGACTCAAACATGGCAGTTGAAATGTTGAAAATTTTTATGTCTTTGCTCGTGGGCATCACTTCAGGCATGT  1480

Query 1481  GGATTTGGTCTGCCAAAACTCTTCACACGTGGCAGAAGTGTTCCAACAGATTGGTGAATTCTGGAAAGGTAAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  GGATTTGGTCTGCCAAAACTCTTCACACGTGGCAAAAGTGTTCTAACCGATTGGTGAATTCTGGGAAGGTAAAG  1554

Query 1555  AGAGAGAAGAGAGGAAATGGTTGGGTGAAGCCTGGAAAAGGCAGTGAGACTGTGGTA  1611
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||
Sbjct 1555  AGAGAGAAGAGGGGGAATGGTTGGGTGAAGCCAGGAAAAGGCAACGAGACTGTGGTA  1611