Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01934
• Subject: XM_017012742.1
• Aligned Length: 998
• Identities: 765
• Gaps: 217

Alignment

Query   1  ATGGGGGGAAGCGCGTTAAACCAGGGAGTCCTGGAAGGGGACGACGCCCCCGGCCAGTCCCTGTACGAGCGGTT  74
           |||      ||.||.|    ||..|..|.||..|||.||.|.|.||||..|     ||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATG------AGTGCCT----CCTCGTGGCCCCAGAATGGAATGCCGCCGTC-----GTCCCTGTACGAGCGGTT  59

Query  75  AAGTCAGAGGATGCTGGACATCTCGGGGGACCGGGGCGTGCTGAAGGACGTCATCCGAGAAGGAGCTGGAGACC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60  AAGTCAGAGGATGCTGGACATCTCGGGGGACCGGGGCGTGCTGAAGGACGTCATCCGAGAAGGAGCTGGAGACC  133

Query 149  TAGTGGCGCCTGATGCTTCGGTGCTAGTGAAATACTCGGGATACCTGGAACACATGGACAGACCCTTCGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134  TAGTGGCGCCTGATGCTTCGGTGCTAGTGAAATACTCGGGATACCTGGAACACATGGACAGACCCTTCGATTCT  207

Query 223  AATTACTTTAGGAAAACTCCTCGGCTAATGAAACTTGGAGAGGATATTACACTGTGGGGCATGGAGCTGGGCCT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208  AATTACTTTAGGAAAACTCCTCGGCTAATGAAACTTGGAGAGGATATTACACTGTGGGGCATGGAGCTGGGCCT  281

Query 297  TCTGAGCATGCGGAGAGGAGAGCTGGCCAGGTTTCTGTTCAAACCGAACTACGCCTATGGAACGCTGGGCTGCC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282  TCTGAGCATGCGGAGAGGAGAGCTGGCCAGGTTTCTGTTCAAACCGAACTACGCCTATGGAACGCTGGGCTGCC  355

Query 371  CTCCCTTGATCCCCCCAAACACCACTGTCCTGTTTGAGATTGAGCTGCTTGACTTCCTGGACTGTGCTGAGTCA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356  CTCCCTTGATCCCCCCAAACACCACTGTCCTGTTTGAGATTGAGCTGCTTGACTTCCTGGACTGTGCTGAGTCA  429

Query 445  GACAAGTTTTGTGCTCTCTCAGCTGAGCAGCAAGACCAATTTCCACTTCAGAAGGTCCTGAAAGTGGCAGCTAC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430  GACAAGTTTTGTGCTCTCTCAGCTGAGCAGCAAGACCAATTTCCACTTCAGAAGGTCCTGAAAGTGGCAGCTAC  503

Query 519  GGAACGGGAGTTTGGCAACTACCTTTTCCGCCAGAATCGTTTCTATGATGCCAAAGTGAGATATAAAAGGGCCC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504  GGAACGGGAGTTTGGCAACTACCTTTTCCGCCAGAATCGTTTCTATGATGCCAAAGTGAGATATAAAAGGGCCC  577

Query 593  TGTTGCTTCTGCGCCGGCGATCAGCACCCCCTGAAGAGCAGCACCTGGTGGAGGCCGCCAAGCTTCCTGTTCTC  666
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578  TATTGCTTCTGCGCCGGCGATCAGCACCCCCTGAAGAGCAGCACCTGGTGGAGGCCGCCAAGCTTCCTGTTCTC  651

Query 667  CTGAACCTGTCCTTTACATACCTGAAGCTAGACCGACCCACCATAGCCCTGTGCTATGGAGAGCAGGCTTTGAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652  CTGAACCTGTCCTTTACATACCTGAAGCTAGACCGACCCACCATAGCCCTGTGCTATGGAGAGCAGGCTTTGAT  725

Query 741  CATTGACCAAAAGAATGCCAAGGCCCTCTTCAGGTGT-----------------GGACAGGCTTGTCTTCTCCT  797
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| 
Sbjct 726  CATTGACCAAAAGAATGCCAAGGCCCTCTTCAGGTGTGGACAGTTCTCTCCTTGGGACAGGCTTGTCTTCTCC-  798

Query 798  GACTGAGTATCAAAAGGCCCGGGATTTTCTAGTTCGAGCCCAGAAGGAGCAACCCTTCAATCATGACATCAATA  871
                                                                                     
Sbjct 799  --------------------------------------------------------------------------  798

Query 872  ATGAGCTGAAGAAACTGGCTAGCTGTTACAGGGACTATGTGGATAAAGAGAAAGAAATGTGGCACCGCATGTTC  945
                                                                                     
Sbjct 799  --------------------------------------------------------------------------  798

Query 946  GCGCCCTGTGGCGATGGTTCTACAGCAGGAGAAAGT  981
                                               
Sbjct 799  ------------------------------------  798