Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01945
• Subject: NM_001161422.1
• Aligned Length: 1294
• Identities: 1052
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGAATAGGCACCTCTGGAAGAGCCAACTGTGTGAGAT  38
                                                |||||.|.|||||.||||||||.|||.|||.|||||||
Sbjct    1  ATGCGGTGCCTTGAAAATGGGACACTGTCCTGTTGGATGAACAAGCACCCCTGGAAGAACCAGCTGAGTGAGAT  74

Query   39  GGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCGGCAGCAGATCAGGACGTACTGGGCGAAGAGTCTCCTCTGGGGAAGCCAGCCA  112
            |||||||||||||||||||||.||||..||.||||||.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|
Sbjct   75  GGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCAGCAGAGGACCAGGACATGCTGGGTGAAGAATCTTCTCTGGGGAAGCCTGCAA  148

Query  113  TGCTGCACCTGCCTTCAGAACAGGGCGCTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAGGAGAATCAAGAGCTCCGA  186
            ||||.||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTACATCTGCCTTCAGAGCAGGGTACTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAAGAGAATCAAGAGCTCCGA  222

Query  187  GATGCCATCCGGCAGAGCAACCAGATTCTGCGGGAGCGCTGCGAGGAGCTTCTGCATTTCCAAGCCAGCCAGAG  260
            ||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct  223  GACGCTATCCGGCAGAGCAATCAGATGCTGAGGGAACGCTGTGAGGAGCTGCTGCATTTCCAGGTCAGCCAGCG  296

Query  261  GGAGGAGAAGGAGTTCCTCATGTGCAAGTTCCAGGAGGCCAGGAAACTGGTGGAGAGACTCGGCCTGGAGAAGC  334
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||||..||.|||||||||
Sbjct  297  GGAGGAGAAGGAGTTCCTTATGTGCAAATTCCAGGAAGCCCGGAAGCTGGTGGAGAGACTGAGCTTGGAGAAGC  370

Query  335  TCGATCTGAAGAGGCAGAAGGAGCAGGCTCTGCGGGAGGTGGAGCACCTGAAGAGATGCCAGCAGCAGATGGCT  408
            |.|||||...|||.||||.|||.|||||..|...||||.|||||||.|||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TTGATCTTCGGAGTCAGAGGGAACAGGCCTTAAAGGAGTTGGAGCAACTGAAGAAATGCCAACAGCAGATGGCT  444

Query  409  GAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCCCAGGTGACGTCCTTGCTCGGGGAGCTGCAGGAGAGCCAGAGTCGCTTGGA  482
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  GAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCTCAGGTGACATCATTGCTCGGAGAACTCCAGGAGAGCCAGAGCCGTTTGGA  518

Query  483  GGCTGCCACTAAGGAATGCCAGGCTCTGGAGGGTCGGGCCCGGGCGGCCAGCGAGCAGGCGCGGCAGCTGGAGA  556
            |||||||||.|||||..|.||.|||.|.|||||..||...||.||.|..||.|||||||...|.||||||||||
Sbjct  519  GGCTGCCACCAAGGATCGGCAAGCTTTAGAGGGAAGGATTCGAGCAGTTAGTGAGCAGGTCAGACAGCTGGAGA  592

Query  557  GTGAGCGCGAGGCGCTGCAGCAGCAGCACAGCGTGCAGGTGGACCAGCTGCGCATGCAGGGCCAGAGCGTGGAG  630
            |||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||
Sbjct  593  GTGAGCGGGAGGTGCTACAGCAGCAGCACAGCGTCCAGGTGGACCAGCTGCGTATGCAGAACCAGAGCGTGGAG  666

Query  631  GCCGCGCTCCGCATGGAGCGCCAGGCCGCCTCGGAGGAGAAGAGGAAGCTGGCCCAGTTGCAGGTGGCCTATCA  704
            ||.||..|.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||||||..||||||||
Sbjct  667  GCTGCCTTGCGAATGGAGCGGCAGGCTGCTTCAGAGGAGAAGCGGAAGCTGGCTCAGTTGCAGGCAGCCTATCA  740

Query  705  CCAGCTCTTCCAAGAATACGACAACCACATCAAGAGCAGCGTGGTGGGCAGTGAGCGGAAGCGAGGAATGCAGC  778
            |||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||                  |||   ||.|||||||
Sbjct  741  CCAGCTCTTCCAAGACTACGACAGCCACATTAAGAGCAGC------------------AAG---GGCATGCAGC  793

Query  779  TGGAAGATCTCAAACAGCAGCTCCAGCAGGCCGAGGAGGCCCTGGTGGCCAAACAGGAGGTGATCGATAAGCTG  852
            ||||||||||.|..||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||
Sbjct  794  TGGAAGATCTGAGGCAACAGCTCCAGCAAGCTGAGGAGGCCCTGGTAGCCAAACAGGAATTGATTGATAAGCTG  867

Query  853  AAGGAGGAGGCCGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAGACCGTTCCGGTGCTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAA  926
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  AAAGAGGAGGCTGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAGACTGTGCCAGTCTTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAA  941

Query  927  GGCGGACTTCCAGGCTGAGAGGCAGGCCCGGGAGAAGCTGGCCGAGAAGAAGGAGCTCCTGCAGGAGCAGCTGG  1000
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||..||||||||||||....|||||||||||||||
Sbjct  942  GGCTGACTTCCAAGCTGAGAGGCATGCCCGGGAGAAGCTGGTGGAGAAGAAGGAGTATTTGCAGGAGCAGCTGG  1015

Query 1001  AGCAGCTGCAGAGGGAGTACAGCAAACTGAAGGCCAGCTGTCAGGAGTCGGCCAGGATCGAGGACATGAGGAAG  1074
            |||||||||||.|.||||.||.|||.|||||.|...||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1016  AGCAGCTGCAGCGCGAGTTCAACAAGCTGAAAGTTGGCTGCCATGAGTCAGCCAGGATTGAGGATATGAGGAAG  1089

Query 1075  CGGCATGTCGAGGTCT-CCCAGGCCCCCTTGCCCCCCGCCCCTGCCTACCTCTCCTCTCCCCTGGCCCTGCCCA  1147
            ||||||||.|| |.|| |||||.|.||.||.|.|||.||.||.||..|||.|||||.||...|||||.||.|||
Sbjct 1090  CGGCATGTAGA-GACTCCCCAGCCTCCTTTACTCCCTGCTCCAGCTCACCACTCCTTTCATTTGGCCTTGTCCA  1162

Query 1148  GCCAGAGGAGGAGCCCCCCCGAGGAGCCACCTGACTTCTGCTGTCCCAAGTGCCAGTATCAGGCCCCTGATATG  1221
            .||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1163  ACCAGCGGAGGAGCCCTCCTGAAGAACCTCCTGACTTCTGTTGTCCGAAGTGCCAGTATCAGGCTCCTGATATG  1236

Query 1222  GACACCCTGCAGATACATGTCATGGAGTGCATTGAG  1257
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1237  GACACTCTACAGATACATGTCATGGAGTGCATAGAG  1272