Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01945
• Subject: NM_010547.2
• Aligned Length: 1258
• Identities: 1052
• Gaps: 23

Alignment

Query    1  ATGAATAGGCACCTCTGGAAGAGCCAACTGTGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCGGCAGCAGATCAGGA  74
            |||||.|.|||||.||||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGAACAAGCACCCCTGGAAGAACCAGCTGAGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCAGCAGAGGACCAGGA  74

Query   75  CGTACTGGGCGAAGAGTCTCCTCTGGGGAAGCCAGCCATGCTGCACCTGCCTTCAGAACAGGGCGCTCCTGAGA  148
            |.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct   75  CATGCTGGGTGAAGAATCTTCTCTGGGGAAGCCTGCAATGCTACATCTGCCTTCAGAGCAGGGTACTCCTGAGA  148

Query  149  CCCTCCAGCGCTGCCTGGAGGAGAATCAAGAGCTCCGAGATGCCATCCGGCAGAGCAACCAGATTCTGCGGGAG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.
Sbjct  149  CCCTCCAGCGCTGCCTGGAAGAGAATCAAGAGCTCCGAGACGCTATCCGGCAGAGCAATCAGATGCTGAGGGAA  222

Query  223  CGCTGCGAGGAGCTTCTGCATTTCCAAGCCAGCCAGAGGGAGGAGAAGGAGTTCCTCATGTGCAAGTTCCAGGA  296
            |||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CGCTGTGAGGAGCTGCTGCATTTCCAGGTCAGCCAGCGGGAGGAGAAGGAGTTCCTTATGTGCAAATTCCAGGA  296

Query  297  GGCCAGGAAACTGGTGGAGAGACTCGGCCTGGAGAAGCTCGATCTGAAGAGGCAGAAGGAGCAGGCTCTGCGGG  370
            .|||.||||.||||||||||||||..||.||||||||||.|||||...|||.||||.|||.|||||..|...||
Sbjct  297  AGCCCGGAAGCTGGTGGAGAGACTGAGCTTGGAGAAGCTTGATCTTCGGAGTCAGAGGGAACAGGCCTTAAAGG  370

Query  371  AGGTGGAGCACCTGAAGAGATGCCAGCAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCCCAGGTGACGTCC  444
            ||.|||||||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  AGTTGGAGCAACTGAAGAAATGCCAACAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCTCAGGTGACATCA  444

Query  445  TTGCTCGGGGAGCTGCAGGAGAGCCAGAGTCGCTTGGAGGCTGCCACTAAGGAATGCCAGGCTCTGGAGGGTCG  518
            ||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||.|.|||||..|
Sbjct  445  TTGCTCGGAGAACTCCAGGAGAGCCAGAGCCGTTTGGAGGCTGCCACCAAGGATCGGCAAGCTTTAGAGGGAAG  518

Query  519  GGCCCGGGCGGCCAGCGAGCAGGCGCGGCAGCTGGAGAGTGAGCGCGAGGCGCTGCAGCAGCAGCACAGCGTGC  592
            |...||.||.|..||.|||||||...|.|||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GATTCGAGCAGTTAGTGAGCAGGTCAGACAGCTGGAGAGTGAGCGGGAGGTGCTACAGCAGCAGCACAGCGTCC  592

Query  593  AGGTGGACCAGCTGCGCATGCAGGGCCAGAGCGTGGAGGCCGCGCTCCGCATGGAGCGCCAGGCCGCCTCGGAG  666
            ||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  593  AGGTGGACCAGCTGCGTATGCAGAACCAGAGCGTGGAGGCTGCCTTGCGAATGGAGCGGCAGGCTGCTTCAGAG  666

Query  667  GAGAAGAGGAAGCTGGCCCAGTTGCAGGTGGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGAATACGACAACCACATCAAGAG  740
            ||||||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct  667  GAGAAGCGGAAGCTGGCTCAGTTGCAGGCAGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGACTACGACAGCCACATTAAGAG  740

Query  741  CAGCGTGGTGGGCAGTGAGCGGAAGCGAGGAATGCAGCTGGAAGATCTCAAACAGCAGCTCCAGCAGGCCGAGG  814
            ||||                  |||   ||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  741  CAGC------------------AAG---GGCATGCAGCTGGAAGATCTGAGGCAACAGCTCCAGCAAGCTGAGG  793

Query  815  AGGCCCTGGTGGCCAAACAGGAGGTGATCGATAAGCTGAAGGAGGAGGCCGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG  888
            ||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  AGGCCCTGGTAGCCAAACAGGAATTGATTGATAAGCTGAAAGAGGAGGCTGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG  867

Query  889  ACCGTTCCGGTGCTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCGGACTTCCAGGCTGAGAGGCAGGCCCGGGAGAA  962
            ||.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  868  ACTGTGCCAGTCTTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCTGACTTCCAAGCTGAGAGGCATGCCCGGGAGAA  941

Query  963  GCTGGCCGAGAAGAAGGAGCTCCTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGAGGGAGTACAGCAAACTGAAGGCCA  1036
            |||||..||||||||||||....||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||.|||.|||||.|...
Sbjct  942  GCTGGTGGAGAAGAAGGAGTATTTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGCGCGAGTTCAACAAGCTGAAAGTTG  1015

Query 1037  GCTGTCAGGAGTCGGCCAGGATCGAGGACATGAGGAAGCGGCATGTCGAGGTCT-CCCAGGCCCCCTTGCCCCC  1109
            ||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| |.|| |||||.|.||.||.|.|||
Sbjct 1016  GCTGCCATGAGTCAGCCAGGATTGAGGATATGAGGAAGCGGCATGTAGA-GACTCCCCAGCCTCCTTTACTCCC  1088

Query 1110  CGCCCCTGCCTACCTCTCCTCTCCCCTGGCCCTGCCCAGCCAGAGGAGGAGCCCCCCCGAGGAGCCACCTGACT  1183
            .||.||.||..|||.|||||.||...|||||.||.|||.||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1089  TGCTCCAGCTCACCACTCCTTTCATTTGGCCTTGTCCAACCAGCGGAGGAGCCCTCCTGAAGAACCTCCTGACT  1162

Query 1184  TCTGCTGTCCCAAGTGCCAGTATCAGGCCCCTGATATGGACACCCTGCAGATACATGTCATGGAGTGCATTGAG  1257
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1163  TCTGTTGTCCGAAGTGCCAGTATCAGGCTCCTGATATGGACACTCTACAGATACATGTCATGGAGTGCATAGAG  1236