Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01945
• Subject: XM_006527849.2
• Aligned Length: 1276
• Identities: 1052
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ------------------ATGAATAGGCACCTCTGGAAGAGCCAACTGTGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGG  56
                              |||||.|.|||||.||||||||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACACTGTCCTGTTGGATGAACAAGCACCCCTGGAAGAACCAGCTGAGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGG  74

Query   57  CCCGGCAGCAGATCAGGACGTACTGGGCGAAGAGTCTCCTCTGGGGAAGCCAGCCATGCTGCACCTGCCTTCAG  130
            |||.||||..||.||||||.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CCCAGCAGAGGACCAGGACATGCTGGGTGAAGAATCTTCTCTGGGGAAGCCTGCAATGCTACATCTGCCTTCAG  148

Query  131  AACAGGGCGCTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAGGAGAATCAAGAGCTCCGAGATGCCATCCGGCAGAGC  204
            |.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGGGTACTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAAGAGAATCAAGAGCTCCGAGACGCTATCCGGCAGAGC  222

Query  205  AACCAGATTCTGCGGGAGCGCTGCGAGGAGCTTCTGCATTTCCAAGCCAGCCAGAGGGAGGAGAAGGAGTTCCT  278
            ||.|||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATCAGATGCTGAGGGAACGCTGTGAGGAGCTGCTGCATTTCCAGGTCAGCCAGCGGGAGGAGAAGGAGTTCCT  296

Query  279  CATGTGCAAGTTCCAGGAGGCCAGGAAACTGGTGGAGAGACTCGGCCTGGAGAAGCTCGATCTGAAGAGGCAGA  352
            .||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||||..||.||||||||||.|||||...|||.||||
Sbjct  297  TATGTGCAAATTCCAGGAAGCCCGGAAGCTGGTGGAGAGACTGAGCTTGGAGAAGCTTGATCTTCGGAGTCAGA  370

Query  353  AGGAGCAGGCTCTGCGGGAGGTGGAGCACCTGAAGAGATGCCAGCAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTG  426
            .|||.|||||..|...||||.|||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAACAGGCCTTAAAGGAGTTGGAGCAACTGAAGAAATGCCAACAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTG  444

Query  427  AAAGCCCAGGTGACGTCCTTGCTCGGGGAGCTGCAGGAGAGCCAGAGTCGCTTGGAGGCTGCCACTAAGGAATG  500
            |||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  445  AAAGCTCAGGTGACATCATTGCTCGGAGAACTCCAGGAGAGCCAGAGCCGTTTGGAGGCTGCCACCAAGGATCG  518

Query  501  CCAGGCTCTGGAGGGTCGGGCCCGGGCGGCCAGCGAGCAGGCGCGGCAGCTGGAGAGTGAGCGCGAGGCGCTGC  574
            .||.|||.|.|||||..||...||.||.|..||.|||||||...|.|||||||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct  519  GCAAGCTTTAGAGGGAAGGATTCGAGCAGTTAGTGAGCAGGTCAGACAGCTGGAGAGTGAGCGGGAGGTGCTAC  592

Query  575  AGCAGCAGCACAGCGTGCAGGTGGACCAGCTGCGCATGCAGGGCCAGAGCGTGGAGGCCGCGCTCCGCATGGAG  648
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct  593  AGCAGCAGCACAGCGTCCAGGTGGACCAGCTGCGTATGCAGAACCAGAGCGTGGAGGCTGCCTTGCGAATGGAG  666

Query  649  CGCCAGGCCGCCTCGGAGGAGAAGAGGAAGCTGGCCCAGTTGCAGGTGGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGAATA  722
            ||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  CGGCAGGCTGCTTCAGAGGAGAAGCGGAAGCTGGCTCAGTTGCAGGCAGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGACTA  740

Query  723  CGACAACCACATCAAGAGCAGCGTGGTGGGCAGTGAGCGGAAGCGAGGAATGCAGCTGGAAGATCTCAAACAGC  796
            |||||.||||||.|||||||||                  |||   ||.|||||||||||||||||.|..||.|
Sbjct  741  CGACAGCCACATTAAGAGCAGC------------------AAG---GGCATGCAGCTGGAAGATCTGAGGCAAC  793

Query  797  AGCTCCAGCAGGCCGAGGAGGCCCTGGTGGCCAAACAGGAGGTGATCGATAAGCTGAAGGAGGAGGCCGAGCAG  870
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  794  AGCTCCAGCAAGCTGAGGAGGCCCTGGTAGCCAAACAGGAATTGATTGATAAGCTGAAAGAGGAGGCTGAGCAG  867

Query  871  CACAAGATTGTGATGGAGACCGTTCCGGTGCTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCGGACTTCCAGGCTGA  944
            ||||||||||||||||||||.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  868  CACAAGATTGTGATGGAGACTGTGCCAGTCTTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCTGACTTCCAAGCTGA  941

Query  945  GAGGCAGGCCCGGGAGAAGCTGGCCGAGAAGAAGGAGCTCCTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGAGGGAGT  1018
            ||||||.||||||||||||||||..||||||||||||....||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  942  GAGGCATGCCCGGGAGAAGCTGGTGGAGAAGAAGGAGTATTTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGCGCGAGT  1015

Query 1019  ACAGCAAACTGAAGGCCAGCTGTCAGGAGTCGGCCAGGATCGAGGACATGAGGAAGCGGCATGTCGAGGTCT-C  1091
            .||.|||.|||||.|...||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| |.|| |
Sbjct 1016  TCAACAAGCTGAAAGTTGGCTGCCATGAGTCAGCCAGGATTGAGGATATGAGGAAGCGGCATGTAGA-GACTCC  1088

Query 1092  CCAGGCCCCCTTGCCCCCCGCCCCTGCCTACCTCTCCTCTCCCCTGGCCCTGCCCAGCCAGAGGAGGAGCCCCC  1165
            ||||.|.||.||.|.|||.||.||.||..|||.|||||.||...|||||.||.|||.||||.||||||||||.|
Sbjct 1089  CCAGCCTCCTTTACTCCCTGCTCCAGCTCACCACTCCTTTCATTTGGCCTTGTCCAACCAGCGGAGGAGCCCTC  1162

Query 1166  CCGAGGAGCCACCTGACTTCTGCTGTCCCAAGTGCCAGTATCAGGCCCCTGATATGGACACCCTGCAGATACAT  1239
            |.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1163  CTGAAGAACCTCCTGACTTCTGTTGTCCGAAGTGCCAGTATCAGGCTCCTGATATGGACACTCTACAGATACAT  1236

Query 1240  GTCATGGAGTGCATTGAG  1257
            ||||||||||||||.|||
Sbjct 1237  GTCATGGAGTGCATAGAG  1254