Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01979
• Subject: XM_017015791.2
• Aligned Length: 970
• Identities: 821
• Gaps: 80

Alignment

Query   1  ATGGATTCCAAACACCAGTGTGTAAAGCTAAATGATGGCCACTTCATGCCTGTATTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATATCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  ACCTCCAGAGGTTCCGAGAAGTAAAGCTTTGGAGGTCACAAAATTAGCAATAGAAGCTGGGTTCCGCCATATAG  148
           .|||.||||||||||.|.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTTTAGAGGCCACCAAATTGGCAATTGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTCCACTTTTCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAACTCACTGAAGAAAGC-TCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTCTCCAATGTCTCTAAAG  369
           |||||..|||||||| |||.| |||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||||.|||||.|||  
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAA-AAATCTTCAATTGGATTATGTTGACCTCTACCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAA--  367

Query 370  CCAGGTGAGGAACTTTCACCAACAGATGAAAATGGAAAAGTAATATTTGACATAGTGGATCTCTGTACCACCTG  443
                                                                                     
Sbjct 368  --------------------------------------------------------------------------  367

Query 444  GGAGGCCATGGAGAAGTGTAAGGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATTGGGGTGTCAAACTTCAACCGCAGGCAGC  517
             |||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 368  --AGGCCGTGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCGCAGGCAGC  439

Query 518  TGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGACTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTAGAATGTCATCCGTATTTC  591
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 440  TGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTC  513

Query 592  AACCGGAGTAAATTGCTAGATTTCTGCAAGTCGAAAGATATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCTCA  665
           ||||.|||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 514  AACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCA  587

Query 666  ACGAGACAAACGATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAA  739
           .|||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588  CCGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAA  661

Query 740  AGCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGC  813
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662  AGCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTACAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGC  735

Query 814  TACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTTTTTGAGTTCCAGTTGACTGCAGAGGACATGAAAGCCAT  887
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 736  TACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCAT  809

Query 888  AGATGGCCTAGACAGAAATCTCCACTATTTTAACAGTGATAGTTTTGCTAGCCACCCTAATTATCCATATTCAG  961
           ||||||||||.||||||||.|.|..|||||.|.|..|||||.|||||||.|||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 810  AGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTG  883

Query 962  ATGAATAT  969
           ||||||||
Sbjct 884  ATGAATAT  891