Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02025
- Subject:
- XR_923056.3
- Aligned Length:
- 2833
- Identities:
- 2227
- Gaps:
- 588
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGT 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AACAAGAAACCTACGAACCCAGCTCTGGAAAGAGCCACCTTCTCCAAAATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGT 74
Query 27 TTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGACCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGACCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATT 148
Query 101 CCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACCCCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATT 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACCCCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATT 222
Query 175 GTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCTCACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTG 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCTCACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTG 296
Query 249 CAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGACCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACA 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGACCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACA 370
Query 323 TCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGTTCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGG 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGTTCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGG 444
Query 397 GCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGATTGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGATTGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAA 518
Query 471 CGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTTGGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCA 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTTGGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCA 592
Query 545 AACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGCATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGG 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGCATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGG 666
Query 619 GACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTTGGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGG 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTTGGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGG 740
Query 693 GACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCTGACCTTTCACACGGACATGGCGGTGG 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCTGACCTTTCACACGGACATGGCGGTGG 814
Query 767 CCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCACTAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCACTAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCT 888
Query 841 CTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCATCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGAC 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCATCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGAC 962
Query 915 CCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAACTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCC 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAACTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCC 1036
Query 989 AGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGGGAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAAT 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGGGAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAAT 1110
Query 1063 GGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAGGACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAA 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAGGACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAA 1184
Query 1137 AAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCTGAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGA 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCTGAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGA 1258
Query 1211 CAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCCTCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCCTCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGG 1332
Query 1285 GTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTCATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTC 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTCATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTC 1406
Query 1359 TTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAGCAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAA 1432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTTAGCAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAA 1480
Query 1433 TCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAACACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATC 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAACACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATC 1554
Query 1507 ATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGAGCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTC 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGAGCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTC 1628
Query 1581 CTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGACCCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGA 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGACCCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGA 1702
Query 1655 ACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGGCACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAG 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGGCACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAG 1776
Query 1729 AGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGTGACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGT 1802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGTGACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGT 1850
Query 1803 AGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTACCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGT 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTACCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGT 1924
Query 1877 GTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTTCGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTC 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTTCGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTC 1998
Query 1951 CTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGGACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGGACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCC 2072
Query 2025 AAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAGTGACAGCCAGAGAGAGGGCCAGTATG 2098
||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAACGACCGGACGTTT---------------------------------------------------------- 2088
Query 2099 CCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGCATGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGC 2172
Sbjct 2089 -------------------------------------------------------------------------- 2088
Query 2173 GGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAGCAAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGA 2246
Sbjct 2089 -------------------------------------------------------------------------- 2088
Query 2247 CCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACGACATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGG 2320
|||||||||||||||||
Sbjct 2089 ---------------------------------------------------------CCAGATTGTGTTCGAGG 2105
Query 2321 GAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATTCGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAG 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 GAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATTCGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAG 2179
Query 2395 AACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAGTGGACATCCCAGAAATACATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGA 2468
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2180 AACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAGGGGGCACC----------------------------------- 2218
Query 2469 AATTGATGATGAATACGAGGTGGACTGGAGCAATTCTTCTTCTGCAACCTCAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCG 2542
||.|||| |||| |||||
Sbjct 2219 --------------------------------------CTCCTGC-----CAGG---------------GACCG 2234
Query 2543 A---CAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACACCCTGGATCCCATCCTCATCACCATCATCGCCATGAGCTCACTGG-- 2611
| ||.|| ||.|||| ||..||||| .||.| ||||| || |||..|||||
Sbjct 2235 AGCCCACAG------------TGGACAC---GGTGCCCAT--GCAGC-CCATC----CC---AGCCTACTGGTA 2283
Query 2612 --GCGTCCTCCTGGGGGCCACCTGTGCAGGCCTCCTGCTCTACTGCACCTGTTCCTACTCGGGCCTGAGCTCCC 2683
.|||..| ||||.||.
Sbjct 2284 TTACGTAAT------GGCCGCCG--------------------------------------------------- 2300
Query 2684 GAAGCTGCACCACACTGGAGAACTACAACTTCGAGCTCTACGATGGCCTTAAGCACAAGGTCAAGATGAACCAC 2757
Sbjct 2301 -------------------------------------------------------------------------- 2300
Query 2758 CAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA 2778
Sbjct 2301 --------------------- 2300