Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02027
- Subject:
- NM_001244972.1
- Aligned Length:
- 2772
- Identities:
- 1909
- Gaps:
- 861
Alignment
Query 1 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA 74
Query 75 TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC 148
Query 149 CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC 222
Query 223 TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT 296
Query 297 TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG 370
Query 371 TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC 444
Query 445 CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG 518
Query 519 CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT 592
Query 593 CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT 666
Query 667 CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT 740
Query 741 TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG 814
Query 815 ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG 888
Query 889 TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC 962
Query 963 CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT 1036
Query 1037 CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC 1110
Query 1111 ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT 1184
Query 1185 CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG 1258
Query 1259 AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC 1332
Query 1333 TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC 1406
Query 1407 TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA 1480
Query 1481 TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG 1554
Query 1555 TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA 1628
Query 1629 CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA 1702
Query 1703 GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG 1776
Query 1777 ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGA 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGA----------- 1839
Query 1851 CTTCCAGCTCACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 ----------ACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG 1903
Query 1925 -GTATCAAA----------------------------------------------------------------- 1932
||.||.||
Sbjct 1904 AGTTTCCAACATATGGTTTTAACTGTGAATTTGGCTGGGGCTCTCACAAGACCTTCTGCCACTGGGAACATGAC 1977
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 1978 AATCACGTGCAGCTCAAGTGGAGTGTGTTGACCAGCAAGACGGGACCCATTCAGGATCACACAGCAGGAGATGG 2051
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2052 CAACTTCATCTATTCCCAAGCTGACGAAAATCAGAAGGGCAAAGTGGCTCGCCTGGTGAGCCCTGTGGTTTATT 2125
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2126 CCCAGAACTCTGCCCACTGCATGACCTTCTGGTATCACATGTCTGGGTCCCACGTCGGCACACTCAGGGTCAAA 2199
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2200 CTGCGCTACCAGAAGCCAGAGGAGTACGATCAGCTGGTCTGGATGGCCATTGGACACCAAGGTGACCACTGGAA 2273
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2274 GGAAGGGCGTGTCTTGCTCCACAAGTCTCTGAAACTTTATCAGGTGATTTTCGAGGGCGAAATCGGAAAAGGAA 2347
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2348 ACCTTGGTGGGATTGCTGTGGATGACATTAGTATTAATAACCACATTTCACAAGAAGATTGTGCAAAACCAGCA 2421
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2422 GACCTGGATAAAAAGAACCCAGAAATTAAAATTGATGAAACAGGGAGCACGCCAGGATACGAAGGTGAAGGAGA 2495
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2496 AGGTGACAAGAACATCTCCAGGAAGCCAGGCAATGTGTTGAAGACCTTAGACCCCATCCTCATCACCATCATAG 2569
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2570 CCATGAGTGCCCTGGGGGTCCTCCTGGGGGCTGTCTGTGGGGTCGTGCTGTACTGTGCCTGTTGGCATAATGGG 2643
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2644 ATGTCAGAAAGAAACTTGTCTGCCCTGGAGAACTATAACTTTGAACTTGTGGATGGTGTGAAGTTGAAAAAAGA 2717
Query 1933 ---------------------------------- 1932
Sbjct 2718 CAAACTGAATACACAGAGTACTTATTCGGAGGCA 2751