Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02031
Subject:
XM_011536220.1
Aligned Length:
1116
Identities:
1062
Gaps:
54

Alignment

Query    1  ATGAACAAGCGGCGACTTCTCTACCCCTCAGGGTGGCTCCACGGTCCCAGCGACATGCAGGGGCTCCTCTTCTC  74
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGCAGGGGCTCCTCTTCTC  20

Query   75  CACTCTTCTGCTTGCTGGCCTGGCACAGTTCTGCTGCAGGGTACAGGGCACTGGACCATTAGATACAACACCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  CACTCTTCTGCTTGCTGGCCTGGCACAGTTCTGCTGCAGGGTACAGGGCACTGGACCATTAGATACAACACCTG  94

Query  149  AAGGAAGGCCTGGAGAAGTGTCAGATGCACCTCAGCGTAAACAGTTTTGTCACTGGCCCTGCAAATGCCCTCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  AAGGAAGGCCTGGAGAAGTGTCAGATGCACCTCAGCGTAAACAGTTTTGTCACTGGCCCTGCAAATGCCCTCAG  168

Query  223  CAGAAGCCCCGTTGCCCTCCTGGAGTGAGCCTGGTGAGAGATGGCTGTGGATGCTGTAAAATCTGTGCCAAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  CAGAAGCCCCGTTGCCCTCCTGGAGTGAGCCTGGTGAGAGATGGCTGTGGATGCTGTAAAATCTGTGCCAAGCA  242

Query  297  ACCAGGGGAAATCTGCAATGAAGCTGACCTCTGTGACCCACACAAAGGGCTGTATTGTGACTACTCAGTAGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  ACCAGGGGAAATCTGCAATGAAGCTGACCTCTGTGACCCACACAAAGGGCTGTATTGTGACTACTCAGTAGACA  316

Query  371  GGCCTAGGTACGAGACTGGAGTGTGTGCATACCTTGTAGCTGTTGGGTGCGAGTTCAACCAGGTACATTATCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  GGCCTAGGTACGAGACTGGAGTGTGTGCATACCTTGTAGCTGTTGGGTGCGAGTTCAACCAGGTACATTATCAT  390

Query  445  AATGGCCAAGTGTTTCAGCCCAACCCCTTGTTCAGCTGCCTCTGTGTGAGTGGGGCCATTGGATGCACACCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  AATGGCCAAGTGTTTCAGCCCAACCCCTTGTTCAGCTGCCTCTGTGTGAGTGGGGCCATTGGATGCACACCTCT  464

Query  519  GTTCATACCAAAGCTGGCTGGCAGTCACTGCTCTGGAGCTAAAGGTGGAAAGAAGTCTGATCAGTCAAACTGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  GTTCATACCAAAGCTGGCTGGCAGTCACTGCTCTGGAGCTAAAGGTGGAAAGAAGTCTGATCAGTCAAACTGTA  538

Query  593  GCCTGGAACCATTACTACAGCAGCTTTCAACAAGCTACAAAACAATGCCAGCTTATAGAAATCTCCCACTTATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  GCCTGGAACCATTACTACAGCAGCTTTCAACAAGCTACAAAACAATGCCAGCTTATAGAAATCTCCCACTTATT  612

Query  667  TGGAAAAAAAAATGTCTTGTGCAAGCAACAAAATGGACTCCCTGCTCCAGAACATGTGGGATGGGAATATCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  TGGAAAAAAAAATGTCTTGTGCAAGCAACAAAATGGACTCCCTGCTCCAGAACATGTGGGATGGGAATATCTAA  686

Query  741  CAGGGTGACCAATGAAAACAGCAACTGTGAAATGAGAAAAGAGAAAAGACTGTGTTACATTCAGCCTTGCGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  CAGGGTGACCAATGAAAACAGCAACTGTGAAATGAGAAAAGAGAAAAGACTGTGTTACATTCAGCCTTGCGACA  760

Query  815  GCAATATATTAAAGACAATAAAGATTCCCAAAGGAAAAACATGCCAACCTACTTTCCAACTCTCCAAAGCTGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  GCAATATATTAAAGACAATAAAGATTCCCAAAGGAAAAACATGCCAACCTACTTTCCAACTCTCCAAAGCTGAA  834

Query  889  AAATTTGTCTTTTCTGGATGCTCAAGTACTCAGAGTTACAAACCCACTTTTTGTGGAATATGCTTGGATAAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  AAATTTGTCTTTTCTGGATGCTCAAGTACTCAGAGTTACAAACCCACTTTTTGTGGAATATGCTTGGATAAGAG  908

Query  963  ATGCTGTATCCCTAATAAGTCTAAAATGATTACTATTCAATTTGATTGCCCAAATGAGGGGTCATTTAAATGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  ATGCTGTATCCCTAATAAGTCTAAAATGATTACTATTCAATTTGATTGCCCAAATGAGGGGTCATTTAAATGGA  982

Query 1037  AGATGCTGTGGATTACATCTTGTGTGTGTCAGAGAAACTGCAGAGAACCTGGAGATATATTTTCTGAGCTCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  AGATGCTGTGGATTACATCTTGTGTGTGTCAGAGAAACTGCAGAGAACCTGGAGATATATTTTCTGAGCTCAAG  1056

Query 1111  ATTCTG  1116
            ||||||
Sbjct 1057  ATTCTG  1062