Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02057
• Subject: NM_001136076.2
• Aligned Length: 1606
• Identities: 1399
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGAAACTC------TGGGTGTCTGCATTGCTGATGGCCTGGTTTGGTGTCCTGAGCTGTGTGCAGGCCGAATT  68
            |||||.|||      |.|||||..|..|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAAGCTCCAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGATGTCCTGGTTCGGTGTCCTGAGCTGGGTGCAGGCAGAATT  74

Query   69  CTTCACCTCTATTGGGCACATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACA  142
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CTTCACCTCCATTGGGCACATGACCGATCTGATTTACGCAGAGAAGGACCTGGTACAGTCTCTGAAGGAGTACA  148

Query  143  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCA  216
            ||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.||||..|||
Sbjct  149  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTCGCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAGCAAGATGGAAGCCCTGACCAGCAGATCA  222

Query  217  GCTGCTGATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTG  290
            |||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  223  GCTGCCGACCCCGAGGGCTACCTGGCTCATCCTGTGAATGCCTACAAGCTGGTGAAGCGGTTGAACACAGACTG  296

Query  291  GCCTGCGCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGT  364
            ||||||.||||.||||||||||||.|||||..|..|.|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCTGCACTGGGGGACCTTGTCCTTCAGGATGCTTCGGCAGGTTTTGTCGCTAACCTCTCAGTTCAGCGGCAAT  370

Query  365  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGAC  438
            |||||||||||||||||||||||...||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct  371  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGTCTGGAGCTGCCAGAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACGTACAAACTGGAT  444

Query  439  CCAGGCACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGG  512
            ||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CCGGACACGATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGCACAAAGTACCAGGCCATGCTGAGTGTGGACGACTGCTTTGG  518

Query  513  GATGGGCCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGC  586
            |.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GCTGGGCCGCTCAGCTTACAATGAAGGAGACTATTACCATACTGTGCTGTGGATGGAGCAGGTACTGAAGCAGC  592

Query  587  TTGATGCCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTG  660
            |.|||||.||||||||||||||....||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||..||
Sbjct  593  TCGATGCTGGGGAGGAGGCCACTGTTACCAAGTCCCTGGTGCTGGACTACCTGAGCTATGCTGTCTTCCAACTG  666

Query  661  GGTGATCTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  734
            |||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGACCTGCACCGTGCTGTGGAACTCACCCGCCGCCTGCTCTCTCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  740

Query  735  GAATCTGCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGC  808
            ||||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||.||||..|||.|..|..|||||||||||||.||.|..|
Sbjct  741  GAATCTGCGGTACTTTGAACGGTTGTTAGAGGAAGAAAGAGGGAAATCACTGTCAAATCAGACAGACGCCGGAC  814

Query  809  TAGCAACCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGT  882
            |.||.||||..|||..|.|.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TGGCCACCCAGGAAAACTTGTACGAGAGGCCCACGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTGTACGAGAGCCTGTGT  888

Query  883  CGTGGGGAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGC  956
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.
Sbjct  889  CGAGGGGAGGGCGTGAAACTGACACCCCGGAGGCAGAAGAAGCTTTTCTGTAGGTACCATCATGGAAACAGAGT  962

Query  957  CCCACAGCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATG  1030
            .||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GCCACAGCTCCTCATCGCCCCCTTCAAAGAGGAAGACGAGTGGGACAGCCCACACATCGTCAGGTACTATGATG  1036

Query 1031  TCATGTCTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGAT  1104
            |.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TGATGTCCGACGAAGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATTGCTAAGCCCAAACTTGCACGAGCCACTGTGCGTGAC  1110

Query 1105  CCCAAGACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCC  1178
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  CCCAAGACAGGTGTCCTCACTGTTGCCAGCTACAGAGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAGGATGACGACCC  1184

Query 1179  TGTTGTGGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGG  1252
            ||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||||||||..|.||.||||
Sbjct 1185  TGTTGTGGCCCGGGTCAACCGGCGGATGCAACATATCACCGGGCTAACGGTGAAGACTGCAGAGCTATTGCAGG  1258

Query 1253  TTGCAAATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAGGCGACCTTTTGACAGCGGCCTC  1326
            |.|||||.||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGCAAACTACGGAATGGGGGGACAGTACGAACCACACTTTGACTTCTCAAGGCGACCCTTTGACAGCGGCCTC  1332

Query 1327  AAAACAGAGGGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTT  1400
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAACGGAGGGCAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTATATGAGCGATGTCGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTT  1406

Query 1401  CCCTGATCTGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACC-TCTTGCGGAGCGGG  1473
            .|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||| |||| ||.||.|||
Sbjct 1407  TCCTGACTTGGGAGCTGCTATTTGGCCCAAGAAGGGCACAGCTGTATTCTGGTACAACCTTCTT-CGCAGTGGG  1479

Query 1474  GAAGGTGACTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAATAAGTGGTT  1547
            ||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  GAAGGTGATTATCGGACGAGACATGCAGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAACAAGTGGTT  1553

Query 1548  CCATGAACGAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC  1599
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1554  CCATGAGCGAGGACAGGAGTTCTTAAGACCTTGTGGAACAACGGAAGTTGAT  1605