Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02057
• Subject: NM_001365679.2
• Aligned Length: 1599
• Identities: 1599
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAACTCTGGGTGTCTGCATTGCTGATGGCCTGGTTTGGTGTCCTGAGCTGTGTGCAGGCCGAATTCTTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACTCTGGGTGTCTGCATTGCTGATGGCCTGGTTTGGTGTCCTGAGCTGTGTGCAGGCCGAATTCTTCAC  74

Query   75  CTCTATTGGGCACATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACATCCTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTATTGGGCACATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACATCCTTG  148

Query  149  TGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCAGCTGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCAGCTGCT  222

Query  223  GATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTGGCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTGGCCTGC  296

Query  297  GCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGTTCTTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGTTCTTCC  370

Query  371  CCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGACCCAGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGACCCAGGC  444

Query  445  ACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGGGATGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGGGATGGG  518

Query  519  CCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGCTTGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGCTTGATG  592

Query  593  CCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTGGGTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTGGGTGAT  666

Query  667  CTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGGGAATCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGGGAATCT  740

Query  741  GCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGCTAGCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGCTAGCAA  814

Query  815  CCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGTCGTGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGTCGTGGG  888

Query  889  GAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGCCCCACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGCCCCACA  962

Query  963  GCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATGTCATGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATGTCATGT  1036

Query 1037  CTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGATCCCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGATCCCAAG  1110

Query 1111  ACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCCTGTTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCCTGTTGT  1184

Query 1185  GGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGGTTGCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGGTTGCAA  1258

Query 1259  ATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAGGCGACCTTTTGACAGCGGCCTCAAAACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAGGCGACCTTTTGACAGCGGCCTCAAAACA  1332

Query 1333  GAGGGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTCCCTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTCCCTGA  1406

Query 1407  TCTGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACCTCTTGCGGAGCGGGGAAGGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACCTCTTGCGGAGCGGGGAAGGTG  1480

Query 1481  ACTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAATAAGTGGTTCCATGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAATAAGTGGTTCCATGAA  1554

Query 1555  CGAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC  1599
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC  1599