Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02081
Subject:
NM_019729.3
Aligned Length:
1121
Identities:
916
Gaps:
44

Alignment

Query    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIK  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKTSTKNYIHSAQKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVAVYNLIK  74

Query   75  KRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGT  148
            |||||||||||..|||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||.|..||||||.||||.|.
Sbjct   75  KRPDFKQQQDYYLSILGPANIKKAIEEAERLSESLKLRYEEAEVRKQLEEKDRREEEQLQQQKRQEMGREDSGA  148

Query  149  LAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEKGAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVP  222
            .||.|.||.||||.|||..||||.|.....|.||||||||||||.|||.||||||||..||||.||||.|||||
Sbjct  149  AAKRSVENLLDSKTKTQRINGEKSEGAAAAERGAITAKELYTMMMDKNTSLIIMDARKIQDYQHSCILDSLSVP  222

Query  223  EEAISPGVTASWIEAHLPDDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLV  296
            |||||||||||||||.|.|||||||||||.|.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  EEAISPGVTASWIEANLSDDSKDTWKKRGSVDYVVLLDWFSSAKDLLLGTTLRSLKDALFKWESKTVLRHEPLV  296

Query  297  LEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDENIELISGQNE  370
            ||||||||||||||.|||||||||||...||||.|||||||||||..|||...|.||..||..|...|...|.|
Sbjct  297  LEGGYENWLLCYPQFTTNAKVTPPPRSRAEEVSVSLDFTYPSLEEPVPSKLPTQMPPPPIETNEKALLVTDQDE  370

Query  371  RMGPLNISTP---VEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEEHRIKSESTNHEQQSPQSGKVI  441
            .   |..||.   ..|.||.....||||||.|..|.|||.||||||.|||||.||||||.|.      |||.|.
Sbjct  371  K---LRLSTQPALAGPGAAPRAEASPIIQPAPATKSVPQVDRTKKPSVKLPEDHRIKSENTD------QSGRVL  435

Query  442  PDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEKELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEIT  515
            .|||||||..|||.|||||||||||.|||||||||||||||...||.|||||||.||||.||.|.|.|.|...|
Sbjct  436  SDRSTKPVFPSPTTMLTDEEKARIHQETALLMEKNKQEKELWDKQQKEQKEKLRREEQERKAGKTQDADERDST  509

Query  516  EKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKETSAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVP  589
            |.|.|||...|||.|.|.|.||.|.||....|.||..||||||||.||||..||  ||||||.|.||. ..||.
Sbjct  510  ENQHKAKDGQEKKDSKQTKTEDRELSADGAQEATGTQRQSKSEHEASDAKVPVE--GKRCPTSEAQKR-PADVS  580

Query  590  HTSVTGDSGSGKPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPIT  663
            ..||.|....|                             |||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  581  PASVSGELNAG-----------------------------KAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPLGWAKFLDPIT  625

Query  664  GTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAIQEEEKRKPTVT  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||
Sbjct  626  GTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKVKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQALQEEEKRRPAVT  699

Query  738  PTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQ  811
            |.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  PMVNRENKPPCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQ  773

Query  812  DDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLN  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  774  DDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKVTIGKINDQFAGSSQQDSQELLLFLMDGLHEDLN  847

Query  886  KADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLAST  959
            |||||||.|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||
Sbjct  848  KADNRKRHKEENNEHLDDLQAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCRRRSRTFEAFMYLSLPLAST  921

Query  960  SKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLE  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  SKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLE  995

Query 1034  NLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYT  1107
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  996  NLDLSQYVIGPKNSLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVRSSAAYILFYT  1069

Query 1108  SLGPRVTDVAT  1118
            |||||.|||||
Sbjct 1070  SLGPRITDVAT  1080