Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02081
- Subject:
- NM_019729.3
- Aligned Length:
- 1121
- Identities:
- 916
- Gaps:
- 44
Alignment
Query 1 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIK 74
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Sbjct 1 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKTSTKNYIHSAQKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVAVYNLIK 74
Query 75 KRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGT 148
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Sbjct 75 KRPDFKQQQDYYLSILGPANIKKAIEEAERLSESLKLRYEEAEVRKQLEEKDRREEEQLQQQKRQEMGREDSGA 148
Query 149 LAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEKGAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVP 222
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Sbjct 149 AAKRSVENLLDSKTKTQRINGEKSEGAAAAERGAITAKELYTMMMDKNTSLIIMDARKIQDYQHSCILDSLSVP 222
Query 223 EEAISPGVTASWIEAHLPDDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLV 296
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Sbjct 223 EEAISPGVTASWIEANLSDDSKDTWKKRGSVDYVVLLDWFSSAKDLLLGTTLRSLKDALFKWESKTVLRHEPLV 296
Query 297 LEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDENIELISGQNE 370
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Sbjct 297 LEGGYENWLLCYPQFTTNAKVTPPPRSRAEEVSVSLDFTYPSLEEPVPSKLPTQMPPPPIETNEKALLVTDQDE 370
Query 371 RMGPLNISTP---VEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEEHRIKSESTNHEQQSPQSGKVI 441
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Sbjct 371 K---LRLSTQPALAGPGAAPRAEASPIIQPAPATKSVPQVDRTKKPSVKLPEDHRIKSENTD------QSGRVL 435
Query 442 PDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEKELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEIT 515
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Sbjct 436 SDRSTKPVFPSPTTMLTDEEKARIHQETALLMEKNKQEKELWDKQQKEQKEKLRREEQERKAGKTQDADERDST 509
Query 516 EKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKETSAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVP 589
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Sbjct 510 ENQHKAKDGQEKKDSKQTKTEDRELSADGAQEATGTQRQSKSEHEASDAKVPVE--GKRCPTSEAQKR-PADVS 580
Query 590 HTSVTGDSGSGKPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPIT 663
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Sbjct 581 PASVSGELNAG-----------------------------KAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPLGWAKFLDPIT 625
Query 664 GTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAIQEEEKRKPTVT 737
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Sbjct 626 GTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKVKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQALQEEEKRRPAVT 699
Query 738 PTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQ 811
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Sbjct 700 PMVNRENKPPCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQ 773
Query 812 DDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLN 885
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Sbjct 774 DDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKVTIGKINDQFAGSSQQDSQELLLFLMDGLHEDLN 847
Query 886 KADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLAST 959
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Sbjct 848 KADNRKRHKEENNEHLDDLQAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCRRRSRTFEAFMYLSLPLAST 921
Query 960 SKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLE 1033
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Sbjct 922 SKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLE 995
Query 1034 NLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYT 1107
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Sbjct 996 NLDLSQYVIGPKNSLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVRSSAAYILFYT 1069
Query 1108 SLGPRVTDVAT 1118
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Sbjct 1070 SLGPRITDVAT 1080