Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02081
• Subject: XM_017022718.1
• Aligned Length: 3354
• Identities: 3267
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA  74

Query   75  AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT  148

Query  149  GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA  222

Query  223  AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT  296

Query  297  CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG  370

Query  371  AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA  444

Query  445  TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA  518

Query  519  AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA  592

Query  593  GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT  666

Query  667  GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG  740

Query  741  GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA  814

Query  815  CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT  888

Query  889  TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC  962

Query  963  ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA  1036

Query 1037  AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG  1110

Query 1111  AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT  1184

Query 1185  TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG  1258

Query 1259  AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT  1332

Query 1333  TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC  1406

Query 1407  TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC  1480

Query 1481  TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA  1554

Query 1555  CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA  1628

Query 1629  GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG  1702

Query 1703  TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT  1776

Query 1777  GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGCCATTTAAGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGG  1850
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 1777  GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAG-----------------------------------------------  1803

Query 1851  AACTTTTAGAGAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG  1924
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804  ----------------------------------------GCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG  1837

Query 1925  AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT  1911

Query 1999  CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC  1985

Query 2073  CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT  2059

Query 2147  CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060  CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT  2133

Query 2221  AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT  2207

Query 2295  CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT  2281

Query 2369  CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282  CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT  2355

Query 2443  AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356  AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC  2429

Query 2517  AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430  AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT  2503

Query 2591  ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504  ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT  2577

Query 2665  AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578  AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA  2651

Query 2739  ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652  ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA  2725

Query 2813  CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726  CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT  2799

Query 2887  ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800  ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA  2873

Query 2961  TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874  TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA  2947

Query 3035  AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2948  AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC  3021

Query 3109  TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3022  TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG  3095

Query 3183  TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096  TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC  3169

Query 3257  ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170  ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA  3243

Query 3331  CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA  3354
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3244  CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA  3267